Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NDEL1Q9GZM8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.1 ms