Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
HIRIP3Q9BW71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms