Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN3Q9BTN0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN3Q9BTN0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms