Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP2Q9BQI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRIP2Q9BQI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms