Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT3Q9BQG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT3Q9BQG1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms