Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PANX1Q96RD7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PANX1Q96RD7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX1Q96RD7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms