Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LMTK3Q96Q04 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LMTK3Q96Q04 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMTK3Q96Q04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms