Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAX2Q96IS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAX2Q96IS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms