Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SRCAPQ6ZRS2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRCAPQ6ZRS2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SRCAPQ6ZRS2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms