Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIF1Q5UIP0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RIF1Q5UIP0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms