Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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