Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 RHO4YKR055W 876 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 ATP1YBL099W 1638 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 SNZ3YFL059W 897 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 SNZ2YNL333W 897 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 KEX2YNL238W 2445 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 BRL1YHR036W 1416 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 NOP7YGR103W 1818 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 COX26YDR119W-A 201 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YGR139WYGR139W 339 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YKR073CYKR073C 321 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 SCT1YBL011W 2280 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 FOB1YDR110W 1701 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 SSK22YCR073C 3996 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YDL034WYDL034W 345 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 GIR2YDR152W 798 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 STL1YDR536W 1710 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 SHE10YGL228W 1734 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 CLB1YGR108W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YJL171CYJL171C 1191 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 YLR194CYLR194C 765 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 PGA3YML125C 939 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 PIN2YOR104W 849 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 TNA1YGR260W 1605 nt5.77□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 AAP1YHR047C 2571 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 VPS70YJR126C 2436 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YHR140WYHR140W 720 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 MPM1YJL066C 759 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 CBT1YKL208W 816 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 SEC17YBL050W 879 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 DAL82YNL314W 768 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 RPS15YOL040C 429 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 CPA1YOR303W 1236 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 BPL1YDL141W 2073 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YIR007WYIR007W 2295 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 EIS1YMR031C 2532 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 NOP2YNL061W 1857 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 RBA50YDR527W 1320 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 TRK2YKR050W 2670 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YAP1801YHR161C 1914 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 GYP1YOR070C 1914 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 SNF11YDR073W 510 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YGR176WYGR176W 348 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 COS9YKL219W 1224 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 DOM34YNL001W 1161 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 CCZ1YBR131W 2115 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 SFB3YHR098C 2790 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YDR396WYDR396W 501 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 CAD1YDR423C 1230 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YOL131WYOL131W 327 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 MRP51YPL118W 1035 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 CDC10YCR002C 969 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 IDP1YDL066W 1287 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 TRP1YDR007W 675 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ARP1YHR129C 1155 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 SYN8YAL014C 768 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YML131WYML131W 1098 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ERG7YHR072W 2196 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 UGO1YDR470C 1509 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 TAH18YPR048W 1872 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 MKC7YDR144C 1791 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 RTT106YNL206C 1368 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ARP2YDL029W 1176 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 MRPL13YKR006C 795 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YLL059CYLL059C 507 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ADK2YER170W 678 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 TOM20YGR082W 552 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 APN1YKL114C 1104 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 TFS1YLR178C 660 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YLR296WYLR296W 327 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 YNR048WYNR048W 1182 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 PPR1YLR014C 2715 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 HSF1YGL073W 2502 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ECM7YLR443W 1347 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 NUD1YOR373W 2556 nt5.71□□□□□ -1.49
VPS54Q12071 ATG18YFR021W 1503 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 CWC21YDR482C 408 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YJR115WYJR115W 510 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 PGU1YJR153W 1086 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 GEP5YLR091W 882 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 TEF1YPR080W 1377 nt5.7□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 TEF2YBR118W 1377 nt5.7□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YKL223WYKL223W 333 nt5.7□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YLR317WYLR317W 435 nt5.7□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 CRZ1YNL027W 2037 nt5.7□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 GUS1YGL245W 2127 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 UTP7YER082C 1665 nt5.69□□□□□ -1.5
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