Protein–RNA interactions for Protein: Q02629

NUP100, Nucleoporin NUP100/NSP100, yeastyeast

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP100Q02629 CAD1YDR423C 1230 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 YLL059CYLL059C 507 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 ARG1YOL058W 1263 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 NAT5YOR253W 531 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 AIM3YBR108W 2844 nt5.48□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 NSE5YML023C 1671 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 SFC1YJR095W 969 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 TFS1YLR178C 660 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 YNL194CYNL194C 906 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 YOL079WYOL079W 399 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 BPL1YDL141W 2073 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 BRL1YHR036W 1416 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 RPT1YKL145W 1404 nt5.47□□□□□ -1.53
NUP100Q02629 ACF2YLR144C 2340 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 RTT106YNL206C 1368 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 DIT1YDR403W 1611 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 SIP2YGL208W 1248 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YLR194CYLR194C 765 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YNR068CYNR068C 819 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 JIP4YDR475C 2631 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PIF1YML061C 2580 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 NUD1YOR373W 2556 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YBR138CYBR138C 1575 nt5.46□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 CLB4YLR210W 1383 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 HGH1YGR187C 1185 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 UBC4YBR082C 447 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PTK2YJR059W 2457 nt5.45□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GPT2YKR067W 2232 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GEX1YCL073C 1848 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GEX2YKR106W 1848 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GAA1YLR088W 1845 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YJR115WYJR115W 510 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PHA2YNL316C 1005 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PSH1YOL054W 1221 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YPR195CYPR195C 330 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 RRT2YBR246W 1164 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 AMA1YGR225W 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YHR045WYHR045W 1683 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 ALT1YLR089C 1779 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YGL118CYGL118C 438 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PGU1YJR153W 1086 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 DED81YHR019C 1665 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PCL10YGL134W 1302 nt5.43□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 UTP18YJL069C 1785 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 MTQ2YDR140W 666 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 SYN8YAL014C 768 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 MTQ1YNL063W 945 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 AIM41YOR215C 558 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GEP3YOR205C 1671 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GUS1YGL245W 2127 nt5.42□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 ARP2YDL029W 1176 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 MRPL13YKR006C 795 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 RHO2YNL090W 579 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 PAP2YOL115W 1755 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 WHI4YDL224C 1950 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 SEM1YDR363W-A 270 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YDR541CYDR541C 1035 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YIL060WYIL060W 435 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 YPR098CYPR098C 486 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP100Q02629 GPI18YBR004C 1302 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 SEC12YNR026C 1416 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ALD6YPL061W 1503 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 DEF1YKL054C 2217 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 BZZ1YHR114W 1902 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 YGR291CYGR291C 222 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 IPI1YHR085W 1005 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 YBL044WYBL044W 369 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 RFA2YNL312W 822 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 DSE3YOR264W 1293 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 CBC2YPL178W 627 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ECM2YBR065C 1095 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 TAX4YJL083W 1815 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 RSC2YLR357W 2670 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 TOS4YLR183C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 SCT1YBL011W 2280 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 TIM54YJL054W 1437 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ATG18YFR021W 1503 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 TBF1YPL128C 1689 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 MCM6YGL201C 3054 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 PPR1YLR014C 2715 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 YLR118CYLR118C 684 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 TAF4YMR005W 1167 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ALG5YPL227C 1005 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 RPN5YDL147W 1338 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ATF1YOR377W 1578 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ASH1YKL185W 1767 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 SNT2YGL131C 4212 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 FZF1YGL254W 900 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 SCW4YGR279C 1161 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 PGA2YNL149C 390 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ELC1YPL046C 300 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 KTR3YBR205W 1215 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 PDH1YPR002W 1551 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 HRP1YOL123W 1605 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 HXT3YDR345C 1704 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 ALT2YDR111C 1524 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP100Q02629 RCK1YGL158W 1539 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms