Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX1P83916 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX1P83916 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX1P83916 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX1P83916 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX1P83916 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBX1P83916 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX1P83916 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX1P83916 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX1P83916 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX1P83916 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms