Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE6CP51160 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE6CP51160 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE6CP51160 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms