Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK9P50750 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK9P50750 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK9P50750 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK9P50750 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK9P50750 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK9P50750 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK9P50750 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK9P50750 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK9P50750 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK9P50750 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK9P50750 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK9P50750 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK9P50750 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK9P50750 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK9P50750 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK9P50750 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK9P50750 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK9P50750 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK9P50750 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms