Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCP4P48539 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCP4P48539 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCP4P48539 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCP4P48539 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCP4P48539 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCP4P48539 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCP4P48539 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms