Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRATP43155 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRATP43155 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRATP43155 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRATP43155 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRATP43155 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRATP43155 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRATP43155 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRATP43155 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRATP43155 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRATP43155 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRATP43155 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRATP43155 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRATP43155 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRATP43155 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRATP43155 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRATP43155 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRATP43155 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CRATP43155 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRATP43155 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRATP43155 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRATP43155 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRATP43155 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRATP43155 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRATP43155 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms