Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 EFM4YIL064W 774 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DAL3YIR032C 588 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 LST8YNL006W 912 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 HST2YPL015C 1074 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 SMF3YLR034C 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 HSP104YLL026W 2727 nt5.88□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ADY2YCR010C 852 nt5.88□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 RPT4YOR259C 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 SSZ1YHR064C 1617 nt5.88□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DED81YHR019C 1665 nt5.88□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 TKL1YPR074C 2043 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YEL077CYEL077C 3834 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YDR541CYDR541C 1035 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DCN1YLR128W 810 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 MRP51YPL118W 1035 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 HRP1YOL123W 1605 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ELP3YPL086C 1674 nt5.87□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 RPT1YKL145W 1404 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 VMA16YHR026W 642 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 SYN8YAL014C 768 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 PGU1YJR153W 1086 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ERI1YPL096C-A 207 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 UBC4YBR082C 447 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YPR195CYPR195C 330 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 STE13YOR219C 2796 nt5.86□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DBP9YLR276C 1785 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YDL034WYDL034W 345 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 SPG4YMR107W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DAL82YNL314W 768 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 CRZ1YNL027W 2037 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YAP1801YHR161C 1914 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ABZ1YNR033W 2364 nt5.85□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 SIA1YOR137C 1869 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ARP2YDL029W 1176 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 GCS1YDL226C 1059 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 ARG1YOL058W 1263 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 PIN2YOR104W 849 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 MNN2YBR015C 1794 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 FAT3YKL187C 2253 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 DPH2YKL191W 1605 nt5.84□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 COX26YDR119W-A 201 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 SOH1YGL127C 384 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YGR176WYGR176W 348 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 FOL1YNL256W 2475 nt5.83□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 DEF1YKL054C 2217 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YGL072CYGL072C 360 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YKR041WYKR041W 753 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 GEP5YLR091W 882 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 RPO26YPR187W 468 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 BRF1YGR246C 1791 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YMR027WYMR027W 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YHR045WYHR045W 1683 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 GEP3YOR205C 1671 nt5.82□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 RPT2YDL007W 1314 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YFL034WYFL034W 3222 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YGL036WYGL036W 2730 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YFL064CYFL064C 525 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 MLC1YGL106W 450 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 TFS1YLR178C 660 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YPR202WYPR202W 717 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 NUD1YOR373W 2556 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 SNT2YGL131C 4212 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 DDC1YPL194W 1839 nt5.81□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 VHS1YDR247W 1386 nt5.8□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 ASF2YDL197C 1578 nt5.8□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 QDR1YIL120W 1692 nt5.8□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 GON7YJL184W 372 nt5.8□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 MTW1YAL034W-A 870 nt5.8□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 VMS1YDR049W 1899 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 SSY5YJL156C 2100 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 COS9YKL219W 1224 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 CAR1YPL111W 1002 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 PPR1YLR014C 2715 nt5.79□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 DAK1YML070W 1755 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 QRI1YDL103C 1434 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 NCS6YGL211W 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 FAF1YIL019W 1041 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YLL059CYLL059C 507 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YLR118CYLR118C 684 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 LEM3YNL323W 1245 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 TAX4YJL083W 1815 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 RTT106YNL206C 1368 nt5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P40486 YMR155WYMR155W 1644 nt5.77□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms