Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 VPS24YKL041W 675 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 SRY1YKL218C 981 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 TAF11YML015C 1041 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YNL194CYNL194C 906 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 MRPL10YNL284C 969 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 SCS22YBL091C-A 528 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YBL112CYBL112C 318 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 TSR3YOR006C 942 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 HST3YOR025W 1344 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 PDH1YPR002W 1551 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 GYP1YOR070C 1914 nt4.85□□□□□ -1.63
AVT5P38176 CDC1YDR182W 1476 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 snR78snR78 87 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 PEX7YDR142C 1128 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YEL068CYEL068C 333 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YEL074WYEL074W 339 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 POR2YIL114C 846 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YKL031WYKL031W 414 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 URE2YNL229C 1065 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 YPR098CYPR098C 486 nt4.84□□□□□ -1.63
AVT5P38176 OSW2YLR054C 2175 nt4.84□□□□□ -1.64
AVT5P38176 PTR2YKR093W 1806 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MAK31YCR020C-A 267 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YNL228WYNL228W 777 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 NRM1YNR009W 750 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YNR048WYNR048W 1182 nt4.83□□□□□ -1.64
AVT5P38176 SET5YHR207C 1581 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 SSY5YJL156C 2100 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 SSK1YLR006C 2139 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YET3YDL072C 612 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YER186CYER186C 921 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MRF1YGL143C 1242 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RHO3YIL118W 696 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 KRE9YJL174W 831 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 TDH2YJR009C 999 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 ASK1YKL052C 879 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 CKA2YOR061W 1020 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MDM31YHR194W 1740 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 QDR3YBR043C 2070 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 UBA2YDR390C 1911 nt4.82□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MCM3YEL032W 2916 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 DAL81YIR023W 2913 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 ICL1YER065C 1674 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RPS2YGL123W 765 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YNL234WYNL234W 1281 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 NDJ1YOL104C 1059 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 DSE3YOR264W 1293 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 ELC1YPL046C 300 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YPR114WYPR114W 948 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 GIT1YCR098C 1557 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MKC7YDR144C 1791 nt4.81□□□□□ -1.64
AVT5P38176 SSZ1YHR064C 1617 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MSP1YGR028W 1089 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 NHA1YLR138W 2958 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 MRPL24YMR193W 777 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YNL108CYNL108C 813 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RAD53YPL153C 2466 nt4.8□□□□□ -1.64
AVT5P38176 GLE1YDL207W 1617 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 HES1YOR237W 1305 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 OPI7YDR360W 435 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RAI1YGL246C 1164 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YGR176WYGR176W 348 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 LSM12YHR121W 564 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RFA2YNL312W 822 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 BAP2YBR068C 1830 nt4.79□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RPT4YOR259C 1314 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 NGL2YMR285C 1548 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 CDC4YFL009W 2340 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YDR015CYDR015C 240 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 GRX4YER174C 735 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YFR035CYFR035C 345 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 HAP2YGL237C 798 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 HAP3YBL021C 435 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 CAF40YNL288W 1122 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YOL079WYOL079W 399 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 RBD2YPL246C 789 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 YPK2YMR104C 2034 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 PDI1YCL043C 1569 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 CLB4YLR210W 1383 nt4.78□□□□□ -1.64
AVT5P38176 TAH18YPR048W 1872 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 SOG2YOR353C 2376 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 BSC5YNR069C 1470 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 HVG1YER039C 750 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 YER187WYER187W 426 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 RME1YGR044C 903 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 YIL060WYIL060W 435 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 YJR085CYJR085C 318 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 DRE2YKR071C 1047 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 PGA2YNL149C 390 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 MRPL36YBR122C 534 nt4.77□□□□□ -1.65
AVT5P38176 PDB1YBR221C 1101 nt4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms