Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRHP20396 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRHP20396 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRHP20396 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRHP20396 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TRHP20396 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRHP20396 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRHP20396 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRHP20396 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRHP20396 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRHP20396 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRHP20396 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRHP20396 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TRHP20396 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRHP20396 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRHP20396 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRHP20396 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
TRHP20396 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRHP20396 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRHP20396 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
TRHP20396 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRHP20396 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRHP20396 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRHP20396 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRHP20396 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRHP20396 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRHP20396 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRHP20396 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRHP20396 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRHP20396 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRHP20396 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRHP20396 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRHP20396 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRHP20396 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRHP20396 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRHP20396 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRHP20396 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TRHP20396 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRHP20396 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRHP20396 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRHP20396 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRHP20396 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRHP20396 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRHP20396 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRHP20396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRHP20396 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRHP20396 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRHP20396 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRHP20396 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRHP20396 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TRHP20396 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRHP20396 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRHP20396 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRHP20396 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRHP20396 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRHP20396 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms