Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPIND1P05546 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPIND1P05546 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms