Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4dO09126 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema4dO09126 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4dO09126 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms