Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MEIS1O00470 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS1O00470 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms