Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPH6UMI1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GABARAPH6UMI1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPH6UMI1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms