Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L11C9JVI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L11C9JVI0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L11C9JVI0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms