Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DXG7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DXG7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DXG7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DXG7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DXG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DXG7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4DXG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DXG7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DXG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DXG7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DXG7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DXG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DXG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DXG7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DXG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DXG7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DXG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DXG7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DXG7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DXG7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DXG7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DXG7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DXG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms