Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNCNA6PVL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms