Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF316A6NFI3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF316A6NFI3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF316A6NFI3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms