Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)24.57■■□□□ 1.523e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)24.57■■□□□ 1.523e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.523e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)23.58■■□□□ 1.373e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.773e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 519.33■□□□□ 0.683e-16■■■■■ 142.7
AATFQ9NY61 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 38.84□□□□□ -0.993e-16■■■■■ 142.7
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AATFQ9NY61 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.397e-15■■■■■ 131.6
AATFQ9NY61 UIMC1-204ENST00000503273 955 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-15■■■■■ 131.6
AATFQ9NY61 UIMC1-213ENST00000512031 2467 ntTSL 510.07□□□□□ -0.87e-15■■■■■ 131.6
AATFQ9NY61 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.817e-15■■■■■ 131.6
AATFQ9NY61 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.087e-15■■■■■ 131.6
AATFQ9NY61 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 131.4
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AATFQ9NY61 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-13■■■■■ 127.7
AATFQ9NY61 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-13■■■■■ 127.7
AATFQ9NY61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-27■■■■■ 124.8
AATFQ9NY61 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-27■■■■■ 124.8
AATFQ9NY61 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-27■■■■■ 124.8
AATFQ9NY61 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC8.38□□□□□ -1.073e-22■■■■■ 121.2
AATFQ9NY61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.226e-8■■■■■ 121
AATFQ9NY61 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 121
AATFQ9NY61 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 310.12□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 119.4
AATFQ9NY61 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.171e-323■■■■■ 118.7
AATFQ9NY61 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 118.6
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AATFQ9NY61 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 517.94■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 511.8□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 118.2
AATFQ9NY61 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.561e-323■■■■■ 116.8
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AATFQ9NY61 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.351e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.491e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 311.57□□□□□ -0.561e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 410.43□□□□□ -0.741e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.791e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.821e-28■■■■■ 116.4
AATFQ9NY61 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.261e-28■■■■■ 116.4
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AATFQ9NY61 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 324.41■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 423.45■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 322.93■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 116.2
AATFQ9NY61 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 518.49■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 116.2
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AATFQ9NY61 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.88□□□□□ -2.114e-8■■■■■ 116
AATFQ9NY61 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.51□□□□□ -2.174e-8■■■■■ 116
AATFQ9NY61 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.34e-8■■■■■ 116
AATFQ9NY61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.582e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.572e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 324.33■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)22.49■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 221.04■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 115.6
AATFQ9NY61 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18■□□□□ 0.472e-32■■■■■ 114.4
AATFQ9NY61 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 108.8
AATFQ9NY61 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 108.8
AATFQ9NY61 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.881e-7■■■■■ 105.3
AATFQ9NY61 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.41■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 105.3
AATFQ9NY61 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 105.3
AATFQ9NY61 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 105.3
AATFQ9NY61 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 522.13■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 105.3
AATFQ9NY61 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 219.43■□□□□ 0.75e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.115e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.35e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 38□□□□□ -1.135e-11■■■■■ 104.9
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-25■■■■■ 104.8
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