Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.591e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 217■□□□□ 0.311e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 516.81■□□□□ 0.281e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 415.68■□□□□ 0.11e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 415.41■□□□□ 0.061e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.011e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 415.06■□□□□ 01e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.03■□□□□ -01e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 313.5□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 513.36□□□□□ -0.271e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-285ENST00000627152 846 ntTSL 512.56□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-336ENST00000631189 1156 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 511.56□□□□□ -0.561e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 511.56□□□□□ -0.561e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 310.76□□□□□ -0.691e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-331ENST00000630863 954 ntTSL 510.65□□□□□ -0.71e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 510.51□□□□□ -0.731e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.731e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-281ENST00000626969 745 ntTSL 510.06□□□□□ -0.81e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-225ENST00000594715 729 ntTSL 59.95□□□□□ -0.821e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-216ENST00000451228 604 ntTSL 39.34□□□□□ -0.911e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-274ENST00000626617 1014 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-327ENST00000630417 918 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 58.57□□□□□ -1.041e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-293ENST00000627562 1184 ntTSL 58.28□□□□□ -1.081e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-304ENST00000628301 772 ntTSL 58.16□□□□□ -1.11e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-259ENST00000625776 911 ntTSL 57.79□□□□□ -1.161e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-208ENST00000431767 486 ntTSL 57.62□□□□□ -1.191e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-288ENST00000627363 731 ntTSL 57.56□□□□□ -1.21e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-215ENST00000451216 405 ntTSL 57.46□□□□□ -1.221e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-317ENST00000629686 669 ntTSL 57.12□□□□□ -1.271e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MIA3-205ENST00000450260 605 ntTSL 27.1□□□□□ -1.271e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-324ENST00000630243 955 ntTSL 57.05□□□□□ -1.281e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-252ENST00000620737 702 ntTSL 56.68□□□□□ -1.341e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.41e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-267ENST00000626178 342 ntTSL 56.28□□□□□ -1.41e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-335ENST00000631105 702 ntTSL 56.13□□□□□ -1.431e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 56.04□□□□□ -1.441e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.531e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.581e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 MIA3-208ENST00000475451 552 ntTSL 34.93□□□□□ -1.621e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-211ENST00000494189 933 ntTSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.631e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 LINC00969-251ENST00000618708 606 ntTSL 54.55□□□□□ -1.681e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-208ENST00000479855 501 ntTSL 23.96□□□□□ -1.781e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-206ENST00000465612 551 ntTSL 23.25□□□□□ -1.891e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.951e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-209ENST00000486067 722 ntTSL 32.8□□□□□ -1.961e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-207ENST00000475249 1477 ntTSL 32.38□□□□□ -2.031e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-212ENST00000495820 851 ntTSL 1 (best)1.98□□□□□ -2.091e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-210ENST00000490645 791 ntTSL 31.79□□□□□ -2.121e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 PPP1R1C-205ENST00000464264 411 ntTSL 31.45□□□□□ -2.181e-15■■■■■ 133.4
TBRG4Q969Z0 NDRG2-276ENST00000557676 633 ntTSL 224.59■■□□□ 1.532e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-245ENST00000555657 578 ntTSL 523.87■■□□□ 1.412e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-247ENST00000555733 924 ntTSL 522.64■■□□□ 1.212e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-254ENST00000556420 671 ntTSL 422.33■■□□□ 1.172e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-241ENST00000555142 609 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.82e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.62e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-235ENST00000554489 573 ntTSL 418.63■□□□□ 0.572e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-239ENST00000554893 578 ntTSL 418.6■□□□□ 0.572e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-238ENST00000554833 571 ntTSL 418.6■□□□□ 0.572e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-243ENST00000555384 775 ntTSL 518.43■□□□□ 0.542e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 417.12■□□□□ 0.336e-15■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-252ENST00000556329 609 ntTSL 417.08■□□□□ 0.322e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-266ENST00000557198 583 ntTSL 216.49■□□□□ 0.232e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-270ENST00000557318 515 ntTSL 216.49■□□□□ 0.232e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-268ENST00000557274 571 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 ETV6-204ENST00000544715 733 ntTSL 316.26■□□□□ 0.196e-15■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 215.84■□□□□ 0.132e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-273ENST00000557616 579 ntTSL 514.57□□□□□ -0.082e-19■■■■■ 129.5
TBRG4Q969Z0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.22e-19■■■■■ 129.5
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 273.8 ms