Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa21Q8C1P2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa21Q8C1P2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa21Q8C1P2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa21Q8C1P2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa21Q8C1P2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa21Q8C1P2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa21Q8C1P2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa21Q8C1P2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa21Q8C1P2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa21Q8C1P2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa21Q8C1P2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa21Q8C1P2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa21Q8C1P2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa21Q8C1P2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms