Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-294ENST00000626515 1041 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-231ENST00000439892 578 ntTSL 45.41□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-246ENST00000595459 624 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-315ENST00000627487 668 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-311ENST00000627189 740 ntTSL 55.26□□□□□ -1.572e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-325ENST00000628305 1063 ntTSL 55.19□□□□□ -1.582e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-220ENST00000423402 553 ntTSL 45.12□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-331ENST00000628659 922 ntTSL 55.04□□□□□ -1.62e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-222ENST00000425333 546 ntTSL 44.66□□□□□ -1.662e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-229ENST00000437456 583 ntTSL 44.54□□□□□ -1.682e-11■■■■■ 120.9
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Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 3457.4 ms