RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629178.2

PCBP1-AS1-338, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 517 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.28■□□□□ 0.2
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FOXD1Q16676 465 aa12.56□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ADRA2BP18089 450 aa12.54□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.48□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 KCNA4P22459 653 aa12.2□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.9□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.6□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.47□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MSH5O43196 834 aa11.4□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZBTB22O15209 634 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.1□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.95□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SLC4A2P04920 1241 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.68□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FKBP8Q14318 412 aa10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.4□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.753e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SLC24A1O60721 1099 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 APLP2Q06481 763 aa10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 POTEDQ86YR6 584 aa10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FBXO3Q9UK99 471 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PROM2Q8N271 834 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 FBLN2P98095 1184 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RNF39Q9H2S5 420 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 POLA2Q14181 598 aa9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CAPN15O75808 1086 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PLCB2Q00722 1185 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ABCB7O75027 752 aa9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PKD2Q13563 968 aa9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.53□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPDYE6P0CI01 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DSG3P32926 999 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.5□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPOCK2Q92563 424 aa9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 OSCARQ8IYS5 282 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 KLHL34Q8N239 644 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.41□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.36□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 MIER1Q8N108 512 aa9.36□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 BCANQ96GW7 911 aa9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RGL2O15211 777 aa9.3□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PLEKHG5O94827 1062 aa9.29□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TRIM41Q8WV44 630 aa9.23□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CFAP44Q96MT7 982 aa9.23□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.21□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.2□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 GSE1Q14687 1217 aa9.14□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.14□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.13□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.11□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.11□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 NUBP1P53384 320 aa9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-338ENST00000629178 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms