Protein–RNA interactions for Protein: Q12675

DNF2, Phospholipid-transporting ATPase DNF2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF2Q12675 LSM3YLR438C-A 270 nt18.27■□□□□ 0.52
DNF2Q12675 PTC2YER089C 1395 nt18.27■□□□□ 0.52
DNF2Q12675 YBL100CYBL100C 315 nt18.14■□□□□ 0.49
DNF2Q12675 POA1YBR022W 534 nt18.13■□□□□ 0.49
DNF2Q12675 BUD23YCR047C 828 nt18.11■□□□□ 0.49
DNF2Q12675 HUA1YGR268C 597 nt18.07■□□□□ 0.48
DNF2Q12675 FIS1YIL065C 468 nt18.05■□□□□ 0.48
DNF2Q12675 FPR4YLR449W 1179 nt17.94■□□□□ 0.46
DNF2Q12675 IDH1YNL037C 1083 nt17.92■□□□□ 0.46
DNF2Q12675 NAB2YGL122C 1578 nt17.91■□□□□ 0.46
DNF2Q12675 YDR433WYDR433W 441 nt17.9■□□□□ 0.46
DNF2Q12675 YJL152WYJL152W 360 nt17.9■□□□□ 0.46
DNF2Q12675 PHO4YFR034C 939 nt17.89■□□□□ 0.45
DNF2Q12675 TRM9YML014W 840 nt17.87■□□□□ 0.45
DNF2Q12675 MXR2YCL033C 507 nt17.87■□□□□ 0.45
DNF2Q12675 DAL1YIR027C 1383 nt17.84■□□□□ 0.45
DNF2Q12675 FUN26YAL022C 1554 nt17.8■□□□□ 0.44
DNF2Q12675 PAU16YKL224C 372 nt17.8■□□□□ 0.44
DNF2Q12675 INM2YDR287W 879 nt17.8■□□□□ 0.44
DNF2Q12675 YKR040CYKR040C 504 nt17.8■□□□□ 0.44
DNF2Q12675 CCT6YDR188W 1641 nt17.74■□□□□ 0.43
DNF2Q12675 GBP2YCL011C 1284 nt17.61■□□□□ 0.41
DNF2Q12675 PTH1YHR189W 573 nt17.56■□□□□ 0.4
DNF2Q12675 SUF2tP(AGG)C 72 nt17.49■□□□□ 0.39
DNF2Q12675 SUF10tP(AGG)N 72 nt17.49■□□□□ 0.39
DNF2Q12675 PRE6YOL038W 765 nt17.47■□□□□ 0.39
DNF2Q12675 ALF1YNL148C 765 nt17.44■□□□□ 0.38
DNF2Q12675 YPS1YLR120C 1710 nt17.39■□□□□ 0.37
DNF2Q12675 TIR4YOR009W 1464 nt17.38■□□□□ 0.37
DNF2Q12675 YFR018CYFR018C 1092 nt17.35■□□□□ 0.37
DNF2Q12675 FRD1YEL047C 1413 nt17.29■□□□□ 0.36
DNF2Q12675 YLR235CYLR235C 399 nt17.29■□□□□ 0.36
DNF2Q12675 YKL030WYKL030W 606 nt17.25■□□□□ 0.35
DNF2Q12675 RRT5YFR032C 870 nt17.23■□□□□ 0.35
DNF2Q12675 TCD2YKL027W 1344 nt17.22■□□□□ 0.35
DNF2Q12675 YDR095CYDR095C 411 nt17.21■□□□□ 0.35
DNF2Q12675 SNF6YHL025W 999 nt17.19■□□□□ 0.34
DNF2Q12675 LCB1YMR296C 1677 nt17.18■□□□□ 0.34
DNF2Q12675 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.14■□□□□ 0.33
DNF2Q12675 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.04■□□□□ 0.32
DNF2Q12675 DED1YOR204W 1815 nt17■□□□□ 0.31
DNF2Q12675 CAC2YML102W 1407 nt17■□□□□ 0.31
DNF2Q12675 SOR2YDL246C 1074 nt16.99■□□□□ 0.31
DNF2Q12675 SOR1YJR159W 1074 nt16.99■□□□□ 0.31
DNF2Q12675 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt16.96■□□□□ 0.31
DNF2Q12675 YCL042WYCL042W 360 nt16.94■□□□□ 0.3
DNF2Q12675 DIC1YLR348C 897 nt16.9■□□□□ 0.3
DNF2Q12675 YMR057CYMR057C 372 nt16.85■□□□□ 0.29
DNF2Q12675 RRD1YIL153W 1182 nt16.85■□□□□ 0.29
DNF2Q12675 NAT4YMR069W 858 nt16.82■□□□□ 0.28
DNF2Q12675 ART5YGR068C 1761 nt16.81■□□□□ 0.28
DNF2Q12675 TIM23YNR017W 669 nt16.8■□□□□ 0.28
DNF2Q12675 YMR244WYMR244W 1068 nt16.78■□□□□ 0.28
DNF2Q12675 GFD2YCL036W 1701 nt16.77■□□□□ 0.28
DNF2Q12675 RPP2AYOL039W 321 nt16.76■□□□□ 0.27
DNF2Q12675 FMT1YBL013W 1206 nt16.72■□□□□ 0.27
DNF2Q12675 PEX25YPL112C 1185 nt16.68■□□□□ 0.26
DNF2Q12675 RTS2YOR077W 699 nt16.67■□□□□ 0.26
DNF2Q12675 PTP1YDL230W 1008 nt16.67■□□□□ 0.26
DNF2Q12675 YFL066CYFL066C 1179 nt16.65■□□□□ 0.26
DNF2Q12675 GLK1YCL040W 1503 nt16.64■□□□□ 0.25
DNF2Q12675 PET9YBL030C 957 nt16.61■□□□□ 0.25
DNF2Q12675 MSF1YPR047W 1410 nt16.61■□□□□ 0.25
DNF2Q12675 YLR179CYLR179C 606 nt16.59■□□□□ 0.25
DNF2Q12675 RBG2YGR173W 1107 nt16.53■□□□□ 0.24
DNF2Q12675 YPR064WYPR064W 420 nt16.53■□□□□ 0.24
DNF2Q12675 GLR1YPL091W 1452 nt16.52■□□□□ 0.24
DNF2Q12675 FPS1YLL043W 2010 nt16.46■□□□□ 0.23
DNF2Q12675 MIR1YJR077C 936 nt16.45■□□□□ 0.22
DNF2Q12675 CWP1YKL096W 720 nt16.45■□□□□ 0.22
DNF2Q12675 TAD3YLR316C 969 nt16.43■□□□□ 0.22
DNF2Q12675 WSC2YNL283C 1512 nt16.41■□□□□ 0.22
DNF2Q12675 DCW1YKL046C 1350 nt16.38■□□□□ 0.21
DNF2Q12675 MEP2YNL142W 1500 nt16.37■□□□□ 0.21
DNF2Q12675 RAD51YER095W 1203 nt16.37■□□□□ 0.21
DNF2Q12675 RPM1RPM1 483 nt16.37■□□□□ 0.21
DNF2Q12675 THI74YDR438W 1113 nt16.35■□□□□ 0.21
DNF2Q12675 YNL115CYNL115C 1935 nt16.33■□□□□ 0.2
DNF2Q12675 FMP52YER004W 696 nt16.33■□□□□ 0.2
DNF2Q12675 ADH2YMR303C 1047 nt16.33■□□□□ 0.2
DNF2Q12675 SPT5YML010W 3192 nt16.29■□□□□ 0.2
DNF2Q12675 YSP3YOR003W 1437 nt16.26■□□□□ 0.19
DNF2Q12675 CUE1YMR264W 612 nt16.23■□□□□ 0.19
DNF2Q12675 IRC15YPL017C 1500 nt16.19■□□□□ 0.18
DNF2Q12675 AHT1YHR093W 549 nt16.19■□□□□ 0.18
DNF2Q12675 BDH1YAL060W 1149 nt16.12■□□□□ 0.17
DNF2Q12675 NDI1YML120C 1542 nt16.11■□□□□ 0.17
DNF2Q12675 SAM1YLR180W 1149 nt16.08■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 DAT1YML113W 747 nt16.08■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 YLR415CYLR415C 339 nt16.07■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 EMI2YDR516C 1503 nt16.06■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 VPS75YNL246W 795 nt16.05■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 YIL100WYIL100W 354 nt16.04■□□□□ 0.16
DNF2Q12675 RNQ1YCL028W 1218 nt16.01■□□□□ 0.15
DNF2Q12675 YIH1YCR059C 777 nt16■□□□□ 0.15
DNF2Q12675 YGL034CYGL034C 366 nt15.99■□□□□ 0.15
DNF2Q12675 YDL221WYDL221W 552 nt15.98■□□□□ 0.15
DNF2Q12675 YSC84YHR016C 1407 nt15.96■□□□□ 0.15
DNF2Q12675 YNR029CYNR029C 1290 nt15.95■□□□□ 0.14
DNF2Q12675 GIS3YLR094C 1509 nt15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms