Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 DAL1YIR027C 1383 nt19.61■□□□□ 0.73
TY2B-BQ12491 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19.58■□□□□ 0.73
TY2B-BQ12491 YEL076CYEL076C 651 nt19.58■□□□□ 0.73
TY2B-BQ12491 YLR464WYLR464W 651 nt19.58■□□□□ 0.73
TY2B-BQ12491 TRM9YML014W 840 nt19.57■□□□□ 0.72
TY2B-BQ12491 FUN26YAL022C 1554 nt19.57■□□□□ 0.72
TY2B-BQ12491 INM2YDR287W 879 nt19.55■□□□□ 0.72
TY2B-BQ12491 ERV46YAL042W 1248 nt19.52■□□□□ 0.71
TY2B-BQ12491 ADO1YJR105W 1023 nt19.49■□□□□ 0.71
TY2B-BQ12491 YJL152WYJL152W 360 nt19.47■□□□□ 0.71
TY2B-BQ12491 CCT6YDR188W 1641 nt19.44■□□□□ 0.7
TY2B-BQ12491 MXR2YCL033C 507 nt19.33■□□□□ 0.68
TY2B-BQ12491 SIS1YNL007C 1059 nt19.27■□□□□ 0.68
TY2B-BQ12491 IDH1YNL037C 1083 nt19.24■□□□□ 0.67
TY2B-BQ12491 YDR433WYDR433W 441 nt19.17■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 TIR4YOR009W 1464 nt19.16■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 YDR094WYDR094W 336 nt19.15■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 ALF1YNL148C 765 nt19.15■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 SUF2tP(AGG)C 72 nt19.14■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 SUF10tP(AGG)N 72 nt19.14■□□□□ 0.66
TY2B-BQ12491 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt19.07■□□□□ 0.64
TY2B-BQ12491 GBP2YCL011C 1284 nt19.06■□□□□ 0.64
TY2B-BQ12491 YDR095CYDR095C 411 nt19.05■□□□□ 0.64
TY2B-BQ12491 YPS1YLR120C 1710 nt19.03■□□□□ 0.64
TY2B-BQ12491 YKR040CYKR040C 504 nt19.01■□□□□ 0.63
TY2B-BQ12491 PTH1YHR189W 573 nt18.92■□□□□ 0.62
TY2B-BQ12491 HUA1YGR268C 597 nt18.85■□□□□ 0.61
TY2B-BQ12491 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt18.73■□□□□ 0.59
TY2B-BQ12491 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.69■□□□□ 0.58
TY2B-BQ12491 FRD1YEL047C 1413 nt18.68■□□□□ 0.58
TY2B-BQ12491 SBA1YKL117W 651 nt18.68■□□□□ 0.58
TY2B-BQ12491 TCD2YKL027W 1344 nt18.66■□□□□ 0.58
TY2B-BQ12491 ART5YGR068C 1761 nt18.65■□□□□ 0.58
TY2B-BQ12491 CAC2YML102W 1407 nt18.63■□□□□ 0.57
TY2B-BQ12491 GFD2YCL036W 1701 nt18.63■□□□□ 0.57
TY2B-BQ12491 YMR057CYMR057C 372 nt18.63■□□□□ 0.57
TY2B-BQ12491 PAU16YKL224C 372 nt18.62■□□□□ 0.57
TY2B-BQ12491 DED1YOR204W 1815 nt18.58■□□□□ 0.56
TY2B-BQ12491 PRE6YOL038W 765 nt18.53■□□□□ 0.56
TY2B-BQ12491 PTP1YDL230W 1008 nt18.5■□□□□ 0.55
TY2B-BQ12491 RPP2AYOL039W 321 nt18.5■□□□□ 0.55
TY2B-BQ12491 RTS2YOR077W 699 nt18.5■□□□□ 0.55
TY2B-BQ12491 SOR2YDL246C 1074 nt18.47■□□□□ 0.55
TY2B-BQ12491 SOR1YJR159W 1074 nt18.47■□□□□ 0.55
TY2B-BQ12491 RRD1YIL153W 1182 nt18.45■□□□□ 0.54
TY2B-BQ12491 LCB1YMR296C 1677 nt18.4■□□□□ 0.54
TY2B-BQ12491 YLR235CYLR235C 399 nt18.36■□□□□ 0.53
TY2B-BQ12491 FMT1YBL013W 1206 nt18.35■□□□□ 0.53
TY2B-BQ12491 YKL030WYKL030W 606 nt18.34■□□□□ 0.53
TY2B-BQ12491 PET9YBL030C 957 nt18.33■□□□□ 0.53
TY2B-BQ12491 YCL042WYCL042W 360 nt18.32■□□□□ 0.52
TY2B-BQ12491 YFR018CYFR018C 1092 nt18.27■□□□□ 0.51
TY2B-BQ12491 FPS1YLL043W 2010 nt18.25■□□□□ 0.51
TY2B-BQ12491 DCW1YKL046C 1350 nt18.18■□□□□ 0.5
TY2B-BQ12491 TIM23YNR017W 669 nt18.12■□□□□ 0.49
TY2B-BQ12491 MEP2YNL142W 1500 nt18.11■□□□□ 0.49
TY2B-BQ12491 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt18.08■□□□□ 0.48
TY2B-BQ12491 CWP1YKL096W 720 nt18■□□□□ 0.47
TY2B-BQ12491 CUE1YMR264W 612 nt17.98■□□□□ 0.47
TY2B-BQ12491 IRC15YPL017C 1500 nt17.97■□□□□ 0.47
TY2B-BQ12491 DIC1YLR348C 897 nt17.97■□□□□ 0.47
TY2B-BQ12491 RRT5YFR032C 870 nt17.94■□□□□ 0.46
TY2B-BQ12491 SNF6YHL025W 999 nt17.94■□□□□ 0.46
TY2B-BQ12491 YLR179CYLR179C 606 nt17.94■□□□□ 0.46
TY2B-BQ12491 ADH2YMR303C 1047 nt17.93■□□□□ 0.46
TY2B-BQ12491 FMP52YER004W 696 nt17.86■□□□□ 0.45
TY2B-BQ12491 EMI2YDR516C 1503 nt17.81■□□□□ 0.44
TY2B-BQ12491 YFL066CYFL066C 1179 nt17.8■□□□□ 0.44
TY2B-BQ12491 WSC2YNL283C 1512 nt17.76■□□□□ 0.43
TY2B-BQ12491 PEX25YPL112C 1185 nt17.75■□□□□ 0.43
TY2B-BQ12491 YPR064WYPR064W 420 nt17.75■□□□□ 0.43
TY2B-BQ12491 SPT5YML010W 3192 nt17.7■□□□□ 0.42
TY2B-BQ12491 YDL221WYDL221W 552 nt17.64■□□□□ 0.41
TY2B-BQ12491 TAD3YLR316C 969 nt17.62■□□□□ 0.41
TY2B-BQ12491 YIL100WYIL100W 354 nt17.61■□□□□ 0.41
TY2B-BQ12491 GIS3YLR094C 1509 nt17.6■□□□□ 0.41
TY2B-BQ12491 YIH1YCR059C 777 nt17.56■□□□□ 0.4
TY2B-BQ12491 NAT4YMR069W 858 nt17.53■□□□□ 0.4
TY2B-BQ12491 PCM1YEL058W 1674 nt17.5■□□□□ 0.39
TY2B-BQ12491 YNL115CYNL115C 1935 nt17.48■□□□□ 0.39
TY2B-BQ12491 GLK1YCL040W 1503 nt17.46■□□□□ 0.39
TY2B-BQ12491 YSP3YOR003W 1437 nt17.46■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 AHT1YHR093W 549 nt17.45■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 MIR1YJR077C 936 nt17.45■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 MSF1YPR047W 1410 nt17.44■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 YSC84YHR016C 1407 nt17.42■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 YLL053CYLL053C 459 nt17.4■□□□□ 0.38
TY2B-BQ12491 BDH1YAL060W 1149 nt17.38■□□□□ 0.37
TY2B-BQ12491 RNQ1YCL028W 1218 nt17.37■□□□□ 0.37
TY2B-BQ12491 FTR1YER145C 1215 nt17.34■□□□□ 0.37
TY2B-BQ12491 YMR244WYMR244W 1068 nt17.33■□□□□ 0.36
TY2B-BQ12491 BIO4YNR057C 714 nt17.32■□□□□ 0.36
TY2B-BQ12491 SDH1YKL148C 1923 nt17.32■□□□□ 0.36
TY2B-BQ12491 SCC4YER147C 1875 nt17.31■□□□□ 0.36
TY2B-BQ12491 YLR415CYLR415C 339 nt17.28■□□□□ 0.36
TY2B-BQ12491 TRM5YHR070W 1500 nt17.21■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 THI74YDR438W 1113 nt17.2■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 GAL1YBR020W 1587 nt17.18■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 YMR090WYMR090W 684 nt17.17■□□□□ 0.34
TY2B-BQ12491 GLR1YPL091W 1452 nt17.16■□□□□ 0.34
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