Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 CCT6YDR188W 1641 nt15.31■□□□□ 0.04
NYV1Q12255 YJL152WYJL152W 360 nt15.18■□□□□ 0.02
NYV1Q12255 LPX1YOR084W 1164 nt15.18■□□□□ 0.02
NYV1Q12255 SPP1YPL138C 1062 nt15.17■□□□□ 0.02
NYV1Q12255 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.13■□□□□ 0.01
NYV1Q12255 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.13■□□□□ 0.01
NYV1Q12255 ALF1YNL148C 765 nt15.13■□□□□ 0.01
NYV1Q12255 UBX6YJL048C 1191 nt15.1■□□□□ 0.01
NYV1Q12255 ADO1YJR105W 1023 nt15.09■□□□□ 0.01
NYV1Q12255 ERV46YAL042W 1248 nt15.06■□□□□ 0
NYV1Q12255 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.05■□□□□ -0
NYV1Q12255 YEL076CYEL076C 651 nt15.05■□□□□ -0
NYV1Q12255 YLR464WYLR464W 651 nt15.05■□□□□ -0
NYV1Q12255 IDH1YNL037C 1083 nt15.02■□□□□ -0
NYV1Q12255 YDR433WYDR433W 441 nt15□□□□□ -0.01
NYV1Q12255 RTG1YOL067C 534 nt14.99□□□□□ -0.01
NYV1Q12255 SIS1YNL007C 1059 nt14.95□□□□□ -0.02
NYV1Q12255 YPS1YLR120C 1710 nt14.93□□□□□ -0.02
NYV1Q12255 YKR040CYKR040C 504 nt14.92□□□□□ -0.02
NYV1Q12255 YDR095CYDR095C 411 nt14.91□□□□□ -0.02
NYV1Q12255 GBP2YCL011C 1284 nt14.87□□□□□ -0.03
NYV1Q12255 MXR2YCL033C 507 nt14.87□□□□□ -0.03
NYV1Q12255 TIR4YOR009W 1464 nt14.87□□□□□ -0.03
NYV1Q12255 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.77□□□□□ -0.05
NYV1Q12255 HUA1YGR268C 597 nt14.68□□□□□ -0.06
NYV1Q12255 CAC2YML102W 1407 nt14.67□□□□□ -0.06
NYV1Q12255 YMR057CYMR057C 372 nt14.67□□□□□ -0.06
NYV1Q12255 ART5YGR068C 1761 nt14.66□□□□□ -0.06
NYV1Q12255 RPP2AYOL039W 321 nt14.66□□□□□ -0.06
NYV1Q12255 YDR094WYDR094W 336 nt14.61□□□□□ -0.07
NYV1Q12255 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.61□□□□□ -0.07
NYV1Q12255 TCD2YKL027W 1344 nt14.59□□□□□ -0.07
NYV1Q12255 PTP1YDL230W 1008 nt14.57□□□□□ -0.08
NYV1Q12255 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.56□□□□□ -0.08
NYV1Q12255 PET9YBL030C 957 nt14.56□□□□□ -0.08
NYV1Q12255 GFD2YCL036W 1701 nt14.51□□□□□ -0.09
NYV1Q12255 Q0182Q0182 405 nt14.5□□□□□ -0.09
NYV1Q12255 FRD1YEL047C 1413 nt14.49□□□□□ -0.09
NYV1Q12255 DED1YOR204W 1815 nt14.48□□□□□ -0.09
NYV1Q12255 PTH1YHR189W 573 nt14.47□□□□□ -0.09
NYV1Q12255 RRD1YIL153W 1182 nt14.41□□□□□ -0.1
NYV1Q12255 MEP2YNL142W 1500 nt14.41□□□□□ -0.1
NYV1Q12255 YKL030WYKL030W 606 nt14.36□□□□□ -0.11
NYV1Q12255 FPS1YLL043W 2010 nt14.34□□□□□ -0.11
NYV1Q12255 YCL042WYCL042W 360 nt14.33□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 FMT1YBL013W 1206 nt14.32□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 RTS2YOR077W 699 nt14.31□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 YLR235CYLR235C 399 nt14.29□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 LCB1YMR296C 1677 nt14.27□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 DCW1YKL046C 1350 nt14.27□□□□□ -0.12
NYV1Q12255 SPT5YML010W 3192 nt14.24□□□□□ -0.13
NYV1Q12255 SBA1YKL117W 651 nt14.23□□□□□ -0.13
NYV1Q12255 SOR2YDL246C 1074 nt14.22□□□□□ -0.13
NYV1Q12255 SOR1YJR159W 1074 nt14.22□□□□□ -0.13
NYV1Q12255 PAU16YKL224C 372 nt14.13□□□□□ -0.15
NYV1Q12255 IRC15YPL017C 1500 nt14.13□□□□□ -0.15
NYV1Q12255 CWP1YKL096W 720 nt14.12□□□□□ -0.15
NYV1Q12255 CUE1YMR264W 612 nt14.11□□□□□ -0.15
NYV1Q12255 EMI2YDR516C 1503 nt14.08□□□□□ -0.16
NYV1Q12255 ADH2YMR303C 1047 nt14.06□□□□□ -0.16
NYV1Q12255 PRE6YOL038W 765 nt14.04□□□□□ -0.16
NYV1Q12255 YFR018CYFR018C 1092 nt14.03□□□□□ -0.16
NYV1Q12255 FMP52YER004W 696 nt14.02□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 TIM23YNR017W 669 nt14.02□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 GIS3YLR094C 1509 nt14.01□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 YDL221WYDL221W 552 nt14.01□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 RRT5YFR032C 870 nt13.99□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.99□□□□□ -0.17
NYV1Q12255 DIC1YLR348C 897 nt13.95□□□□□ -0.18
NYV1Q12255 YIL100WYIL100W 354 nt13.93□□□□□ -0.18
NYV1Q12255 YLR179CYLR179C 606 nt13.92□□□□□ -0.18
NYV1Q12255 YMR090WYMR090W 684 nt13.87□□□□□ -0.19
NYV1Q12255 YPR064WYPR064W 420 nt13.86□□□□□ -0.19
NYV1Q12255 PCM1YEL058W 1674 nt13.85□□□□□ -0.19
NYV1Q12255 SNF6YHL025W 999 nt13.84□□□□□ -0.19
NYV1Q12255 TAD3YLR316C 969 nt13.81□□□□□ -0.2
NYV1Q12255 YFL066CYFL066C 1179 nt13.8□□□□□ -0.2
NYV1Q12255 WSC2YNL283C 1512 nt13.78□□□□□ -0.2
NYV1Q12255 RNQ1YCL028W 1218 nt13.77□□□□□ -0.21
NYV1Q12255 SCC4YER147C 1875 nt13.75□□□□□ -0.21
NYV1Q12255 AHT1YHR093W 549 nt13.74□□□□□ -0.21
NYV1Q12255 YIH1YCR059C 777 nt13.72□□□□□ -0.21
NYV1Q12255 SDH1YKL148C 1923 nt13.72□□□□□ -0.21
NYV1Q12255 PEX25YPL112C 1185 nt13.66□□□□□ -0.22
NYV1Q12255 NAT4YMR069W 858 nt13.64□□□□□ -0.23
NYV1Q12255 YLL053CYLL053C 459 nt13.61□□□□□ -0.23
NYV1Q12255 YBR220CYBR220C 1683 nt13.59□□□□□ -0.23
NYV1Q12255 YSP3YOR003W 1437 nt13.58□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 BDH1YAL060W 1149 nt13.58□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 YNL115CYNL115C 1935 nt13.57□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 YSC84YHR016C 1407 nt13.56□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 GLK1YCL040W 1503 nt13.54□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 YNL195CYNL195C 786 nt13.53□□□□□ -0.24
NYV1Q12255 FTR1YER145C 1215 nt13.52□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 BIO4YNR057C 714 nt13.51□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 GAL1YBR020W 1587 nt13.5□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 RRT12YCR045C 1476 nt13.5□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 YLR415CYLR415C 339 nt13.49□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 AQY1YPR192W 918 nt13.49□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 MSF1YPR047W 1410 nt13.48□□□□□ -0.25
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