Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 ADO1YJR105W 1023 nt19.7■□□□□ 0.74
TY1B-BRQ12193 PHO4YFR034C 939 nt19.68■□□□□ 0.74
TY1B-BRQ12193 FPR4YLR449W 1179 nt19.67■□□□□ 0.74
TY1B-BRQ12193 NAB2YGL122C 1578 nt19.64■□□□□ 0.73
TY1B-BRQ12193 ERV46YAL042W 1248 nt19.59■□□□□ 0.73
TY1B-BRQ12193 TRM9YML014W 840 nt19.55■□□□□ 0.72
TY1B-BRQ12193 DAL1YIR027C 1383 nt19.52■□□□□ 0.71
TY1B-BRQ12193 FUN26YAL022C 1554 nt19.51■□□□□ 0.71
TY1B-BRQ12193 INM2YDR287W 879 nt19.49■□□□□ 0.71
TY1B-BRQ12193 YJL152WYJL152W 360 nt19.48■□□□□ 0.71
TY1B-BRQ12193 CCT6YDR188W 1641 nt19.39■□□□□ 0.69
TY1B-BRQ12193 MXR2YCL033C 507 nt19.39■□□□□ 0.69
TY1B-BRQ12193 YDR094WYDR094W 336 nt19.35■□□□□ 0.69
TY1B-BRQ12193 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt19.32■□□□□ 0.68
TY1B-BRQ12193 SIS1YNL007C 1059 nt19.31■□□□□ 0.68
TY1B-BRQ12193 IDH1YNL037C 1083 nt19.29■□□□□ 0.68
TY1B-BRQ12193 YDR433WYDR433W 441 nt19.24■□□□□ 0.67
TY1B-BRQ12193 TIR4YOR009W 1464 nt19.11■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 SUF2tP(AGG)C 72 nt19.09■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 SUF10tP(AGG)N 72 nt19.09■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 YKR040CYKR040C 504 nt19.09■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 ALF1YNL148C 765 nt19.09■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 GBP2YCL011C 1284 nt19.09■□□□□ 0.65
TY1B-BRQ12193 YPS1YLR120C 1710 nt19.02■□□□□ 0.63
TY1B-BRQ12193 HUA1YGR268C 597 nt19.01■□□□□ 0.63
TY1B-BRQ12193 PTH1YHR189W 573 nt18.98■□□□□ 0.63
TY1B-BRQ12193 SBA1YKL117W 651 nt18.96■□□□□ 0.63
TY1B-BRQ12193 YDR095CYDR095C 411 nt18.93■□□□□ 0.62
TY1B-BRQ12193 PAU16YKL224C 372 nt18.79■□□□□ 0.6
TY1B-BRQ12193 FRD1YEL047C 1413 nt18.71■□□□□ 0.59
TY1B-BRQ12193 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt18.7■□□□□ 0.58
TY1B-BRQ12193 TCD2YKL027W 1344 nt18.66■□□□□ 0.58
TY1B-BRQ12193 PRE6YOL038W 765 nt18.65■□□□□ 0.58
TY1B-BRQ12193 CAC2YML102W 1407 nt18.6■□□□□ 0.57
TY1B-BRQ12193 YMR057CYMR057C 372 nt18.58■□□□□ 0.57
TY1B-BRQ12193 ART5YGR068C 1761 nt18.57■□□□□ 0.56
TY1B-BRQ12193 DED1YOR204W 1815 nt18.56■□□□□ 0.56
TY1B-BRQ12193 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.56■□□□□ 0.56
TY1B-BRQ12193 GFD2YCL036W 1701 nt18.52■□□□□ 0.56
TY1B-BRQ12193 LCB1YMR296C 1677 nt18.47■□□□□ 0.55
TY1B-BRQ12193 SOR2YDL246C 1074 nt18.45■□□□□ 0.54
TY1B-BRQ12193 SOR1YJR159W 1074 nt18.45■□□□□ 0.54
TY1B-BRQ12193 RRD1YIL153W 1182 nt18.43■□□□□ 0.54
TY1B-BRQ12193 YKL030WYKL030W 606 nt18.42■□□□□ 0.54
TY1B-BRQ12193 YLR235CYLR235C 399 nt18.42■□□□□ 0.54
TY1B-BRQ12193 YFR018CYFR018C 1092 nt18.39■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 RPP2AYOL039W 321 nt18.39■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 RTS2YOR077W 699 nt18.39■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 PTP1YDL230W 1008 nt18.38■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 FMT1YBL013W 1206 nt18.35■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 YCL042WYCL042W 360 nt18.34■□□□□ 0.53
TY1B-BRQ12193 PET9YBL030C 957 nt18.27■□□□□ 0.51
TY1B-BRQ12193 FPS1YLL043W 2010 nt18.18■□□□□ 0.5
TY1B-BRQ12193 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt18.16■□□□□ 0.5
TY1B-BRQ12193 TIM23YNR017W 669 nt18.14■□□□□ 0.5
TY1B-BRQ12193 SNF6YHL025W 999 nt18.12■□□□□ 0.49
TY1B-BRQ12193 RRT5YFR032C 870 nt18.11■□□□□ 0.49
TY1B-BRQ12193 DIC1YLR348C 897 nt18.04■□□□□ 0.48
TY1B-BRQ12193 DCW1YKL046C 1350 nt18■□□□□ 0.47
TY1B-BRQ12193 CWP1YKL096W 720 nt17.99■□□□□ 0.47
TY1B-BRQ12193 YLR179CYLR179C 606 nt17.96■□□□□ 0.47
TY1B-BRQ12193 MEP2YNL142W 1500 nt17.92■□□□□ 0.46
TY1B-BRQ12193 ADH2YMR303C 1047 nt17.91■□□□□ 0.46
TY1B-BRQ12193 YFL066CYFL066C 1179 nt17.9■□□□□ 0.46
TY1B-BRQ12193 CUE1YMR264W 612 nt17.87■□□□□ 0.45
TY1B-BRQ12193 IRC15YPL017C 1500 nt17.84■□□□□ 0.45
TY1B-BRQ12193 FMP52YER004W 696 nt17.81■□□□□ 0.44
TY1B-BRQ12193 PEX25YPL112C 1185 nt17.81■□□□□ 0.44
TY1B-BRQ12193 YPR064WYPR064W 420 nt17.8■□□□□ 0.44
TY1B-BRQ12193 WSC2YNL283C 1512 nt17.78■□□□□ 0.44
TY1B-BRQ12193 NAT4YMR069W 858 nt17.68■□□□□ 0.42
TY1B-BRQ12193 TAD3YLR316C 969 nt17.67■□□□□ 0.42
TY1B-BRQ12193 EMI2YDR516C 1503 nt17.64■□□□□ 0.41
TY1B-BRQ12193 GLK1YCL040W 1503 nt17.6■□□□□ 0.41
TY1B-BRQ12193 MSF1YPR047W 1410 nt17.56■□□□□ 0.4
TY1B-BRQ12193 YNL115CYNL115C 1935 nt17.55■□□□□ 0.4
TY1B-BRQ12193 MIR1YJR077C 936 nt17.54■□□□□ 0.4
TY1B-BRQ12193 YMR244WYMR244W 1068 nt17.53■□□□□ 0.4
TY1B-BRQ12193 YIH1YCR059C 777 nt17.53■□□□□ 0.4
TY1B-BRQ12193 YSP3YOR003W 1437 nt17.51■□□□□ 0.39
TY1B-BRQ12193 YIL100WYIL100W 354 nt17.51■□□□□ 0.39
TY1B-BRQ12193 AHT1YHR093W 549 nt17.48■□□□□ 0.39
TY1B-BRQ12193 GIS3YLR094C 1509 nt17.47■□□□□ 0.39
TY1B-BRQ12193 YDL221WYDL221W 552 nt17.47■□□□□ 0.39
TY1B-BRQ12193 PCM1YEL058W 1674 nt17.45■□□□□ 0.38
TY1B-BRQ12193 BDH1YAL060W 1149 nt17.42■□□□□ 0.38
TY1B-BRQ12193 SPT5YML010W 3192 nt17.41■□□□□ 0.38
TY1B-BRQ12193 YSC84YHR016C 1407 nt17.41■□□□□ 0.38
TY1B-BRQ12193 YLL053CYLL053C 459 nt17.36■□□□□ 0.37
TY1B-BRQ12193 RNQ1YCL028W 1218 nt17.35■□□□□ 0.37
TY1B-BRQ12193 GLR1YPL091W 1452 nt17.33■□□□□ 0.36
TY1B-BRQ12193 THI74YDR438W 1113 nt17.33■□□□□ 0.36
TY1B-BRQ12193 YLR415CYLR415C 339 nt17.32■□□□□ 0.36
TY1B-BRQ12193 FTR1YER145C 1215 nt17.3■□□□□ 0.36
TY1B-BRQ12193 RBG2YGR173W 1107 nt17.3■□□□□ 0.36
TY1B-BRQ12193 BIO4YNR057C 714 nt17.25■□□□□ 0.35
TY1B-BRQ12193 VPS75YNL246W 795 nt17.2■□□□□ 0.34
TY1B-BRQ12193 TRM5YHR070W 1500 nt17.17■□□□□ 0.34
TY1B-BRQ12193 GAL1YBR020W 1587 nt17.15■□□□□ 0.34
TY1B-BRQ12193 SCC4YER147C 1875 nt17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms