Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 IMP2'YIL154C 1041 nt15.31■□□□□ 0.04
SSP2Q08646 YLR236CYLR236C 324 nt15.3■□□□□ 0.04
SSP2Q08646 YJL152WYJL152W 360 nt15.22■□□□□ 0.03
SSP2Q08646 YCH1YGR203W 447 nt15.21■□□□□ 0.03
SSP2Q08646 YPS1YLR120C 1710 nt15.2■□□□□ 0.02
SSP2Q08646 YDR095CYDR095C 411 nt15.17■□□□□ 0.02
SSP2Q08646 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.06■□□□□ 0
SSP2Q08646 SIS1YNL007C 1059 nt15.06■□□□□ 0
SSP2Q08646 IDH1YNL037C 1083 nt15.05■□□□□ -0
SSP2Q08646 LPX1YOR084W 1164 nt15.04■□□□□ -0
SSP2Q08646 MRPL8YJL063C 717 nt14.98□□□□□ -0.01
SSP2Q08646 ERV46YAL042W 1248 nt14.98□□□□□ -0.01
SSP2Q08646 TIR4YOR009W 1464 nt14.95□□□□□ -0.02
SSP2Q08646 YDR433WYDR433W 441 nt14.95□□□□□ -0.02
SSP2Q08646 RPP2AYOL039W 321 nt14.91□□□□□ -0.02
SSP2Q08646 SPP1YPL138C 1062 nt14.9□□□□□ -0.02
SSP2Q08646 GBP2YCL011C 1284 nt14.87□□□□□ -0.03
SSP2Q08646 YKR040CYKR040C 504 nt14.84□□□□□ -0.03
SSP2Q08646 ART5YGR068C 1761 nt14.81□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 ADO1YJR105W 1023 nt14.81□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.79□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 YEL076CYEL076C 651 nt14.79□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 YLR464WYLR464W 651 nt14.79□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 CAC2YML102W 1407 nt14.77□□□□□ -0.04
SSP2Q08646 YMR057CYMR057C 372 nt14.77□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 MXR2YCL033C 507 nt14.77□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 MEP2YNL142W 1500 nt14.76□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 PTP1YDL230W 1008 nt14.76□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 PET9YBL030C 957 nt14.75□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.75□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 RTG1YOL067C 534 nt14.72□□□□□ -0.05
SSP2Q08646 GFD2YCL036W 1701 nt14.69□□□□□ -0.06
SSP2Q08646 TCD2YKL027W 1344 nt14.65□□□□□ -0.06
SSP2Q08646 SPT5YML010W 3192 nt14.62□□□□□ -0.07
SSP2Q08646 UBX6YJL048C 1191 nt14.57□□□□□ -0.08
SSP2Q08646 DCW1YKL046C 1350 nt14.56□□□□□ -0.08
SSP2Q08646 RTS2YOR077W 699 nt14.51□□□□□ -0.09
SSP2Q08646 HUA1YGR268C 597 nt14.5□□□□□ -0.09
SSP2Q08646 DED1YOR204W 1815 nt14.47□□□□□ -0.09
SSP2Q08646 FPS1YLL043W 2010 nt14.46□□□□□ -0.09
SSP2Q08646 FRD1YEL047C 1413 nt14.45□□□□□ -0.1
SSP2Q08646 RRD1YIL153W 1182 nt14.45□□□□□ -0.1
SSP2Q08646 EMI2YDR516C 1503 nt14.41□□□□□ -0.1
SSP2Q08646 YCL042WYCL042W 360 nt14.38□□□□□ -0.11
SSP2Q08646 PTH1YHR189W 573 nt14.37□□□□□ -0.11
SSP2Q08646 IRC15YPL017C 1500 nt14.36□□□□□ -0.11
SSP2Q08646 YDL221WYDL221W 552 nt14.33□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 CUE1YMR264W 612 nt14.33□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 FMT1YBL013W 1206 nt14.31□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 YDR094WYDR094W 336 nt14.3□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 YMR090WYMR090W 684 nt14.29□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 YKL030WYKL030W 606 nt14.28□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 YLR235CYLR235C 399 nt14.28□□□□□ -0.12
SSP2Q08646 SOR2YDL246C 1074 nt14.27□□□□□ -0.13
SSP2Q08646 SOR1YJR159W 1074 nt14.27□□□□□ -0.13
SSP2Q08646 GIS3YLR094C 1509 nt14.25□□□□□ -0.13
SSP2Q08646 YIL100WYIL100W 354 nt14.2□□□□□ -0.14
SSP2Q08646 FMP52YER004W 696 nt14.18□□□□□ -0.14
SSP2Q08646 CWP1YKL096W 720 nt14.18□□□□□ -0.14
SSP2Q08646 LCB1YMR296C 1677 nt14.17□□□□□ -0.14
SSP2Q08646 ADH2YMR303C 1047 nt14.11□□□□□ -0.15
SSP2Q08646 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.07□□□□□ -0.16
SSP2Q08646 SCC4YER147C 1875 nt14.06□□□□□ -0.16
SSP2Q08646 SDH1YKL148C 1923 nt14.05□□□□□ -0.16
SSP2Q08646 TIM23YNR017W 669 nt14.01□□□□□ -0.17
SSP2Q08646 DIC1YLR348C 897 nt13.99□□□□□ -0.17
SSP2Q08646 SNF6YHL025W 999 nt13.98□□□□□ -0.17
SSP2Q08646 PCM1YEL058W 1674 nt13.97□□□□□ -0.17
SSP2Q08646 SSA4YER103W 1929 nt13.95□□□□□ -0.18
SSP2Q08646 YBR220CYBR220C 1683 nt13.95□□□□□ -0.18
SSP2Q08646 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.94□□□□□ -0.18
SSP2Q08646 YLR179CYLR179C 606 nt13.93□□□□□ -0.18
SSP2Q08646 PAU16YKL224C 372 nt13.87□□□□□ -0.19
SSP2Q08646 YNL195CYNL195C 786 nt13.87□□□□□ -0.19
SSP2Q08646 YPR064WYPR064W 420 nt13.87□□□□□ -0.19
SSP2Q08646 RNQ1YCL028W 1218 nt13.86□□□□□ -0.19
SSP2Q08646 YFR018CYFR018C 1092 nt13.85□□□□□ -0.19
SSP2Q08646 YIH1YCR059C 777 nt13.82□□□□□ -0.2
SSP2Q08646 RRT5YFR032C 870 nt13.82□□□□□ -0.2
SSP2Q08646 Q0182Q0182 405 nt13.81□□□□□ -0.2
SSP2Q08646 TAD3YLR316C 969 nt13.78□□□□□ -0.2
SSP2Q08646 PRE6YOL038W 765 nt13.78□□□□□ -0.2
SSP2Q08646 WSC2YNL283C 1512 nt13.74□□□□□ -0.21
SSP2Q08646 RRT12YCR045C 1476 nt13.73□□□□□ -0.21
SSP2Q08646 AHT1YHR093W 549 nt13.72□□□□□ -0.21
SSP2Q08646 YLL053CYLL053C 459 nt13.69□□□□□ -0.22
SSP2Q08646 SBA1YKL117W 651 nt13.66□□□□□ -0.22
SSP2Q08646 YSC84YHR016C 1407 nt13.65□□□□□ -0.22
SSP2Q08646 BIO4YNR057C 714 nt13.65□□□□□ -0.22
SSP2Q08646 SIM1YIL123W 1431 nt13.64□□□□□ -0.23
SSP2Q08646 AQY1YPR192W 918 nt13.63□□□□□ -0.23
SSP2Q08646 FTR1YER145C 1215 nt13.62□□□□□ -0.23
SSP2Q08646 YFL066CYFL066C 1179 nt13.61□□□□□ -0.23
SSP2Q08646 GAL1YBR020W 1587 nt13.58□□□□□ -0.23
SSP2Q08646 PEX25YPL112C 1185 nt13.58□□□□□ -0.24
SSP2Q08646 YHL050CYHL050C 2094 nt13.57□□□□□ -0.24
SSP2Q08646 TRM5YHR070W 1500 nt13.54□□□□□ -0.24
SSP2Q08646 BDH1YAL060W 1149 nt13.51□□□□□ -0.25
SSP2Q08646 YLR415CYLR415C 339 nt13.5□□□□□ -0.25
SSP2Q08646 STB1YNL309W 1263 nt13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms