Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 LPX1YOR084W 1164 nt18.92■□□□□ 0.62
SNT2P53127 SPP1YPL138C 1062 nt18.89■□□□□ 0.61
SNT2P53127 YJL152WYJL152W 360 nt18.87■□□□□ 0.61
SNT2P53127 CCT6YDR188W 1641 nt18.86■□□□□ 0.61
SNT2P53127 IMP2'YIL154C 1041 nt18.84■□□□□ 0.61
SNT2P53127 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt18.77■□□□□ 0.6
SNT2P53127 YEL076CYEL076C 651 nt18.77■□□□□ 0.6
SNT2P53127 YLR464WYLR464W 651 nt18.77■□□□□ 0.6
SNT2P53127 ADO1YJR105W 1023 nt18.75■□□□□ 0.59
SNT2P53127 ALF1YNL148C 765 nt18.73■□□□□ 0.59
SNT2P53127 RTG1YOL067C 534 nt18.64■□□□□ 0.57
SNT2P53127 YDR433WYDR433W 441 nt18.62■□□□□ 0.57
SNT2P53127 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.61■□□□□ 0.57
SNT2P53127 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.61■□□□□ 0.57
SNT2P53127 ERV46YAL042W 1248 nt18.6■□□□□ 0.57
SNT2P53127 IDH1YNL037C 1083 nt18.59■□□□□ 0.57
SNT2P53127 MXR2YCL033C 507 nt18.55■□□□□ 0.56
SNT2P53127 SIS1YNL007C 1059 nt18.52■□□□□ 0.56
SNT2P53127 TIR4YOR009W 1464 nt18.5■□□□□ 0.55
SNT2P53127 YDR095CYDR095C 411 nt18.45■□□□□ 0.54
SNT2P53127 YPS1YLR120C 1710 nt18.44■□□□□ 0.54
SNT2P53127 GBP2YCL011C 1284 nt18.41■□□□□ 0.54
SNT2P53127 YKR040CYKR040C 504 nt18.33■□□□□ 0.53
SNT2P53127 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.32■□□□□ 0.52
SNT2P53127 YDR094WYDR094W 336 nt18.23■□□□□ 0.51
SNT2P53127 HUA1YGR268C 597 nt18.23■□□□□ 0.51
SNT2P53127 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt18.2■□□□□ 0.5
SNT2P53127 YMR057CYMR057C 372 nt18.16■□□□□ 0.5
SNT2P53127 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt18.16■□□□□ 0.5
SNT2P53127 ART5YGR068C 1761 nt18.16■□□□□ 0.5
SNT2P53127 PTH1YHR189W 573 nt18.08■□□□□ 0.49
SNT2P53127 RPP2AYOL039W 321 nt18.07■□□□□ 0.48
SNT2P53127 CAC2YML102W 1407 nt18.06■□□□□ 0.48
SNT2P53127 TCD2YKL027W 1344 nt18.03■□□□□ 0.48
SNT2P53127 GFD2YCL036W 1701 nt18.01■□□□□ 0.47
SNT2P53127 PTP1YDL230W 1008 nt17.98■□□□□ 0.47
SNT2P53127 RTS2YOR077W 699 nt17.96■□□□□ 0.47
SNT2P53127 FRD1YEL047C 1413 nt17.95■□□□□ 0.46
SNT2P53127 DED1YOR204W 1815 nt17.9■□□□□ 0.46
SNT2P53127 PET9YBL030C 957 nt17.89■□□□□ 0.45
SNT2P53127 SBA1YKL117W 651 nt17.87■□□□□ 0.45
SNT2P53127 RRD1YIL153W 1182 nt17.82■□□□□ 0.44
SNT2P53127 MEP2YNL142W 1500 nt17.77■□□□□ 0.44
SNT2P53127 DCW1YKL046C 1350 nt17.74■□□□□ 0.43
SNT2P53127 PAU16YKL224C 372 nt17.72■□□□□ 0.43
SNT2P53127 YCL042WYCL042W 360 nt17.72■□□□□ 0.43
SNT2P53127 FPS1YLL043W 2010 nt17.72■□□□□ 0.43
SNT2P53127 YKL030WYKL030W 606 nt17.71■□□□□ 0.43
SNT2P53127 FMT1YBL013W 1206 nt17.7■□□□□ 0.42
SNT2P53127 LCB1YMR296C 1677 nt17.69■□□□□ 0.42
SNT2P53127 YLR235CYLR235C 399 nt17.64■□□□□ 0.41
SNT2P53127 SOR2YDL246C 1074 nt17.61■□□□□ 0.41
SNT2P53127 SOR1YJR159W 1074 nt17.61■□□□□ 0.41
SNT2P53127 PRE6YOL038W 765 nt17.54■□□□□ 0.4
SNT2P53127 CWP1YKL096W 720 nt17.52■□□□□ 0.4
SNT2P53127 IRC15YPL017C 1500 nt17.48■□□□□ 0.39
SNT2P53127 CUE1YMR264W 612 nt17.45■□□□□ 0.38
SNT2P53127 ADH2YMR303C 1047 nt17.42■□□□□ 0.38
SNT2P53127 EMI2YDR516C 1503 nt17.41■□□□□ 0.38
SNT2P53127 SPT5YML010W 3192 nt17.4■□□□□ 0.38
SNT2P53127 RRT5YFR032C 870 nt17.38■□□□□ 0.37
SNT2P53127 YFR018CYFR018C 1092 nt17.37■□□□□ 0.37
SNT2P53127 TIM23YNR017W 669 nt17.36■□□□□ 0.37
SNT2P53127 DIC1YLR348C 897 nt17.34■□□□□ 0.37
SNT2P53127 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.33■□□□□ 0.36
SNT2P53127 YDL221WYDL221W 552 nt17.31■□□□□ 0.36
SNT2P53127 GIS3YLR094C 1509 nt17.3■□□□□ 0.36
SNT2P53127 YLR179CYLR179C 606 nt17.27■□□□□ 0.35
SNT2P53127 SNF6YHL025W 999 nt17.26■□□□□ 0.35
SNT2P53127 YIL100WYIL100W 354 nt17.26■□□□□ 0.35
SNT2P53127 FMP52YER004W 696 nt17.25■□□□□ 0.35
SNT2P53127 YFL066CYFL066C 1179 nt17.09■□□□□ 0.33
SNT2P53127 PCM1YEL058W 1674 nt17.08■□□□□ 0.32
SNT2P53127 YPR064WYPR064W 420 nt17.08■□□□□ 0.32
SNT2P53127 WSC2YNL283C 1512 nt17.05■□□□□ 0.32
SNT2P53127 YMR090WYMR090W 684 nt17.02■□□□□ 0.31
SNT2P53127 TAD3YLR316C 969 nt17■□□□□ 0.31
SNT2P53127 NAT4YMR069W 858 nt16.99■□□□□ 0.31
SNT2P53127 SCC4YER147C 1875 nt16.97■□□□□ 0.31
SNT2P53127 PEX25YPL112C 1185 nt16.93■□□□□ 0.3
SNT2P53127 SDH1YKL148C 1923 nt16.93■□□□□ 0.3
SNT2P53127 RNQ1YCL028W 1218 nt16.92■□□□□ 0.3
SNT2P53127 YIH1YCR059C 777 nt16.91■□□□□ 0.3
SNT2P53127 GLK1YCL040W 1503 nt16.87■□□□□ 0.29
SNT2P53127 AHT1YHR093W 549 nt16.87■□□□□ 0.29
SNT2P53127 YLL053CYLL053C 459 nt16.82■□□□□ 0.28
SNT2P53127 YNL115CYNL115C 1935 nt16.82■□□□□ 0.28
SNT2P53127 YSC84YHR016C 1407 nt16.8■□□□□ 0.28
SNT2P53127 BIO4YNR057C 714 nt16.77■□□□□ 0.27
SNT2P53127 YBR220CYBR220C 1683 nt16.75■□□□□ 0.27
SNT2P53127 MSF1YPR047W 1410 nt16.75■□□□□ 0.27
SNT2P53127 BDH1YAL060W 1149 nt16.74■□□□□ 0.27
SNT2P53127 YSP3YOR003W 1437 nt16.73■□□□□ 0.27
SNT2P53127 RRT12YCR045C 1476 nt16.72■□□□□ 0.27
SNT2P53127 YNL195CYNL195C 786 nt16.71■□□□□ 0.27
SNT2P53127 FTR1YER145C 1215 nt16.7■□□□□ 0.26
SNT2P53127 YMR244WYMR244W 1068 nt16.69■□□□□ 0.26
SNT2P53127 TRM5YHR070W 1500 nt16.68■□□□□ 0.26
SNT2P53127 GAL1YBR020W 1587 nt16.68■□□□□ 0.26
SNT2P53127 YLR415CYLR415C 339 nt16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms