Protein–RNA interactions for Protein: P43639

CKB1, Casein kinase II subunit beta, yeastyeast

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKB1P43639 YCH1YGR203W 447 nt18.16■□□□□ 0.5
CKB1P43639 MRPL8YJL063C 717 nt18.03■□□□□ 0.48
CKB1P43639 SUF2tP(AGG)C 72 nt18■□□□□ 0.47
CKB1P43639 SUF10tP(AGG)N 72 nt18■□□□□ 0.47
CKB1P43639 ALF1YNL148C 765 nt17.98■□□□□ 0.47
CKB1P43639 LPX1YOR084W 1164 nt17.96■□□□□ 0.47
CKB1P43639 YJL152WYJL152W 360 nt17.93■□□□□ 0.46
CKB1P43639 SPP1YPL138C 1062 nt17.89■□□□□ 0.45
CKB1P43639 ERV46YAL042W 1248 nt17.88■□□□□ 0.45
CKB1P43639 YPS1YLR120C 1710 nt17.87■□□□□ 0.45
CKB1P43639 YDR095CYDR095C 411 nt17.85■□□□□ 0.45
CKB1P43639 IDH1YNL037C 1083 nt17.79■□□□□ 0.44
CKB1P43639 SIS1YNL007C 1059 nt17.77■□□□□ 0.44
CKB1P43639 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt17.76■□□□□ 0.43
CKB1P43639 YEL076CYEL076C 651 nt17.76■□□□□ 0.43
CKB1P43639 YLR464WYLR464W 651 nt17.76■□□□□ 0.43
CKB1P43639 ADO1YJR105W 1023 nt17.74■□□□□ 0.43
CKB1P43639 RTG1YOL067C 534 nt17.73■□□□□ 0.43
CKB1P43639 YDR433WYDR433W 441 nt17.71■□□□□ 0.43
CKB1P43639 TIR4YOR009W 1464 nt17.7■□□□□ 0.42
CKB1P43639 UBX6YJL048C 1191 nt17.66■□□□□ 0.42
CKB1P43639 YKR040CYKR040C 504 nt17.66■□□□□ 0.42
CKB1P43639 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.6■□□□□ 0.41
CKB1P43639 GBP2YCL011C 1284 nt17.6■□□□□ 0.41
CKB1P43639 MXR2YCL033C 507 nt17.59■□□□□ 0.41
CKB1P43639 RPP2AYOL039W 321 nt17.51■□□□□ 0.39
CKB1P43639 ART5YGR068C 1761 nt17.47■□□□□ 0.39
CKB1P43639 CAC2YML102W 1407 nt17.46■□□□□ 0.39
CKB1P43639 PTP1YDL230W 1008 nt17.45■□□□□ 0.38
CKB1P43639 YMR057CYMR057C 372 nt17.43■□□□□ 0.38
CKB1P43639 PET9YBL030C 957 nt17.38■□□□□ 0.37
CKB1P43639 GFD2YCL036W 1701 nt17.33■□□□□ 0.37
CKB1P43639 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.33■□□□□ 0.36
CKB1P43639 MEP2YNL142W 1500 nt17.3■□□□□ 0.36
CKB1P43639 TCD2YKL027W 1344 nt17.29■□□□□ 0.36
CKB1P43639 HUA1YGR268C 597 nt17.29■□□□□ 0.36
CKB1P43639 SPT5YML010W 3192 nt17.26■□□□□ 0.35
CKB1P43639 DED1YOR204W 1815 nt17.24■□□□□ 0.35
CKB1P43639 FRD1YEL047C 1413 nt17.22■□□□□ 0.35
CKB1P43639 YDR094WYDR094W 336 nt17.22■□□□□ 0.35
CKB1P43639 RRD1YIL153W 1182 nt17.17■□□□□ 0.34
CKB1P43639 FPS1YLL043W 2010 nt17.13■□□□□ 0.33
CKB1P43639 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.1■□□□□ 0.33
CKB1P43639 DCW1YKL046C 1350 nt17.1■□□□□ 0.33
CKB1P43639 PTH1YHR189W 573 nt17.08■□□□□ 0.32
CKB1P43639 RTS2YOR077W 699 nt17.05■□□□□ 0.32
CKB1P43639 FMT1YBL013W 1206 nt17.04■□□□□ 0.32
CKB1P43639 YKL030WYKL030W 606 nt16.99■□□□□ 0.31
CKB1P43639 SOR2YDL246C 1074 nt16.96■□□□□ 0.31
CKB1P43639 SOR1YJR159W 1074 nt16.96■□□□□ 0.31
CKB1P43639 YCL042WYCL042W 360 nt16.95■□□□□ 0.3
CKB1P43639 IRC15YPL017C 1500 nt16.93■□□□□ 0.3
CKB1P43639 YLR235CYLR235C 399 nt16.93■□□□□ 0.3
CKB1P43639 LCB1YMR296C 1677 nt16.89■□□□□ 0.29
CKB1P43639 EMI2YDR516C 1503 nt16.87■□□□□ 0.29
CKB1P43639 CUE1YMR264W 612 nt16.85■□□□□ 0.29
CKB1P43639 YDL221WYDL221W 552 nt16.8■□□□□ 0.28
CKB1P43639 GIS3YLR094C 1509 nt16.76■□□□□ 0.27
CKB1P43639 FMP52YER004W 696 nt16.74■□□□□ 0.27
CKB1P43639 CWP1YKL096W 720 nt16.74■□□□□ 0.27
CKB1P43639 ADH2YMR303C 1047 nt16.71■□□□□ 0.27
CKB1P43639 PAU16YKL224C 372 nt16.66■□□□□ 0.26
CKB1P43639 YFR018CYFR018C 1092 nt16.61■□□□□ 0.25
CKB1P43639 SBA1YKL117W 651 nt16.61■□□□□ 0.25
CKB1P43639 TIM23YNR017W 669 nt16.61■□□□□ 0.25
CKB1P43639 YMR090WYMR090W 684 nt16.6■□□□□ 0.25
CKB1P43639 YIL100WYIL100W 354 nt16.59■□□□□ 0.25
CKB1P43639 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt16.58■□□□□ 0.24
CKB1P43639 PRE6YOL038W 765 nt16.58■□□□□ 0.24
CKB1P43639 DIC1YLR348C 897 nt16.57■□□□□ 0.24
CKB1P43639 PCM1YEL058W 1674 nt16.5■□□□□ 0.23
CKB1P43639 RRT5YFR032C 870 nt16.48■□□□□ 0.23
CKB1P43639 YLR179CYLR179C 606 nt16.48■□□□□ 0.23
CKB1P43639 SCC4YER147C 1875 nt16.47■□□□□ 0.23
CKB1P43639 SDH1YKL148C 1923 nt16.47■□□□□ 0.23
CKB1P43639 SNF6YHL025W 999 nt16.45■□□□□ 0.22
CKB1P43639 YPR064WYPR064W 420 nt16.42■□□□□ 0.22
CKB1P43639 RNQ1YCL028W 1218 nt16.4■□□□□ 0.22
CKB1P43639 WSC2YNL283C 1512 nt16.4■□□□□ 0.22
CKB1P43639 YIH1YCR059C 777 nt16.37■□□□□ 0.21
CKB1P43639 TAD3YLR316C 969 nt16.37■□□□□ 0.21
CKB1P43639 YBR220CYBR220C 1683 nt16.35■□□□□ 0.21
CKB1P43639 AHT1YHR093W 549 nt16.34■□□□□ 0.21
CKB1P43639 YFL066CYFL066C 1179 nt16.29■□□□□ 0.2
CKB1P43639 SSA4YER103W 1929 nt16.25■□□□□ 0.19
CKB1P43639 YLL053CYLL053C 459 nt16.19■□□□□ 0.18
CKB1P43639 PEX25YPL112C 1185 nt16.18■□□□□ 0.18
CKB1P43639 BDH1YAL060W 1149 nt16.13■□□□□ 0.17
CKB1P43639 YNL195CYNL195C 786 nt16.13■□□□□ 0.17
CKB1P43639 RRT12YCR045C 1476 nt16.13■□□□□ 0.17
CKB1P43639 YSP3YOR003W 1437 nt16.12■□□□□ 0.17
CKB1P43639 BIO4YNR057C 714 nt16.12■□□□□ 0.17
CKB1P43639 YSC84YHR016C 1407 nt16.11■□□□□ 0.17
CKB1P43639 FTR1YER145C 1215 nt16.11■□□□□ 0.17
CKB1P43639 AQY1YPR192W 918 nt16.08■□□□□ 0.16
CKB1P43639 GAL1YBR020W 1587 nt16.08■□□□□ 0.16
CKB1P43639 YNL115CYNL115C 1935 nt16.07■□□□□ 0.16
CKB1P43639 NAT4YMR069W 858 nt16.06■□□□□ 0.16
CKB1P43639 SIM1YIL123W 1431 nt16.02■□□□□ 0.15
CKB1P43639 TRM5YHR070W 1500 nt16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.4 ms