Protein–RNA interactions for Protein: P42826

XKS1, Xylulose kinase, yeastyeast

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XKS1P42826 MRPL8YJL063C 717 nt15.98■□□□□ 0.15
XKS1P42826 LPX1YOR084W 1164 nt15.84■□□□□ 0.13
XKS1P42826 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.8■□□□□ 0.12
XKS1P42826 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.8■□□□□ 0.12
XKS1P42826 YJL152WYJL152W 360 nt15.79■□□□□ 0.12
XKS1P42826 ALF1YNL148C 765 nt15.79■□□□□ 0.12
XKS1P42826 SPP1YPL138C 1062 nt15.79■□□□□ 0.12
XKS1P42826 ERV46YAL042W 1248 nt15.75■□□□□ 0.11
XKS1P42826 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.72■□□□□ 0.11
XKS1P42826 YEL076CYEL076C 651 nt15.72■□□□□ 0.11
XKS1P42826 ADO1YJR105W 1023 nt15.72■□□□□ 0.11
XKS1P42826 YLR464WYLR464W 651 nt15.72■□□□□ 0.11
XKS1P42826 UBX6YJL048C 1191 nt15.68■□□□□ 0.1
XKS1P42826 IDH1YNL037C 1083 nt15.68■□□□□ 0.1
XKS1P42826 RTG1YOL067C 534 nt15.66■□□□□ 0.1
XKS1P42826 YDR095CYDR095C 411 nt15.62■□□□□ 0.09
XKS1P42826 YDR433WYDR433W 441 nt15.62■□□□□ 0.09
XKS1P42826 YPS1YLR120C 1710 nt15.61■□□□□ 0.09
XKS1P42826 SIS1YNL007C 1059 nt15.58■□□□□ 0.08
XKS1P42826 YKR040CYKR040C 504 nt15.56■□□□□ 0.08
XKS1P42826 TIR4YOR009W 1464 nt15.52■□□□□ 0.08
XKS1P42826 GBP2YCL011C 1284 nt15.5■□□□□ 0.07
XKS1P42826 MXR2YCL033C 507 nt15.49■□□□□ 0.07
XKS1P42826 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.41■□□□□ 0.06
XKS1P42826 HUA1YGR268C 597 nt15.31■□□□□ 0.04
XKS1P42826 RPP2AYOL039W 321 nt15.31■□□□□ 0.04
XKS1P42826 CAC2YML102W 1407 nt15.31■□□□□ 0.04
XKS1P42826 ART5YGR068C 1761 nt15.29■□□□□ 0.04
XKS1P42826 YMR057CYMR057C 372 nt15.28■□□□□ 0.04
XKS1P42826 YDR094WYDR094W 336 nt15.25■□□□□ 0.03
XKS1P42826 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.24■□□□□ 0.03
XKS1P42826 PTP1YDL230W 1008 nt15.23■□□□□ 0.03
XKS1P42826 PET9YBL030C 957 nt15.22■□□□□ 0.03
XKS1P42826 TCD2YKL027W 1344 nt15.21■□□□□ 0.03
XKS1P42826 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.16■□□□□ 0.02
XKS1P42826 GFD2YCL036W 1701 nt15.16■□□□□ 0.02
XKS1P42826 FRD1YEL047C 1413 nt15.15■□□□□ 0.02
XKS1P42826 DED1YOR204W 1815 nt15.11■□□□□ 0.01
XKS1P42826 MEP2YNL142W 1500 nt15.07■□□□□ 0
XKS1P42826 PTH1YHR189W 573 nt15.06■□□□□ 0
XKS1P42826 RRD1YIL153W 1182 nt15.05■□□□□ -0
XKS1P42826 FPS1YLL043W 2010 nt14.99□□□□□ -0.01
XKS1P42826 YKL030WYKL030W 606 nt14.97□□□□□ -0.01
XKS1P42826 FMT1YBL013W 1206 nt14.94□□□□□ -0.02
XKS1P42826 RTS2YOR077W 699 nt14.94□□□□□ -0.02
XKS1P42826 YCL042WYCL042W 360 nt14.93□□□□□ -0.02
XKS1P42826 YLR235CYLR235C 399 nt14.92□□□□□ -0.02
XKS1P42826 SPT5YML010W 3192 nt14.91□□□□□ -0.02
XKS1P42826 DCW1YKL046C 1350 nt14.9□□□□□ -0.02
XKS1P42826 SOR2YDL246C 1074 nt14.9□□□□□ -0.02
XKS1P42826 SOR1YJR159W 1074 nt14.9□□□□□ -0.02
XKS1P42826 LCB1YMR296C 1677 nt14.89□□□□□ -0.03
XKS1P42826 IRC15YPL017C 1500 nt14.76□□□□□ -0.05
XKS1P42826 SBA1YKL117W 651 nt14.75□□□□□ -0.05
XKS1P42826 PAU16YKL224C 372 nt14.75□□□□□ -0.05
XKS1P42826 CUE1YMR264W 612 nt14.75□□□□□ -0.05
XKS1P42826 EMI2YDR516C 1503 nt14.71□□□□□ -0.05
XKS1P42826 CWP1YKL096W 720 nt14.71□□□□□ -0.05
XKS1P42826 FMP52YER004W 696 nt14.68□□□□□ -0.06
XKS1P42826 YFR018CYFR018C 1092 nt14.66□□□□□ -0.06
XKS1P42826 ADH2YMR303C 1047 nt14.66□□□□□ -0.06
XKS1P42826 YDL221WYDL221W 552 nt14.65□□□□□ -0.06
XKS1P42826 PRE6YOL038W 765 nt14.64□□□□□ -0.07
XKS1P42826 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.63□□□□□ -0.07
XKS1P42826 TIM23YNR017W 669 nt14.63□□□□□ -0.07
XKS1P42826 GIS3YLR094C 1509 nt14.62□□□□□ -0.07
XKS1P42826 RRT5YFR032C 870 nt14.59□□□□□ -0.07
XKS1P42826 DIC1YLR348C 897 nt14.58□□□□□ -0.08
XKS1P42826 YIL100WYIL100W 354 nt14.55□□□□□ -0.08
XKS1P42826 YLR179CYLR179C 606 nt14.51□□□□□ -0.09
XKS1P42826 YMR090WYMR090W 684 nt14.48□□□□□ -0.09
XKS1P42826 PCM1YEL058W 1674 nt14.46□□□□□ -0.09
XKS1P42826 YPR064WYPR064W 420 nt14.46□□□□□ -0.09
XKS1P42826 SNF6YHL025W 999 nt14.45□□□□□ -0.1
XKS1P42826 TAD3YLR316C 969 nt14.41□□□□□ -0.1
XKS1P42826 WSC2YNL283C 1512 nt14.41□□□□□ -0.1
XKS1P42826 RNQ1YCL028W 1218 nt14.38□□□□□ -0.11
XKS1P42826 SCC4YER147C 1875 nt14.37□□□□□ -0.11
XKS1P42826 YFL066CYFL066C 1179 nt14.36□□□□□ -0.11
XKS1P42826 AHT1YHR093W 549 nt14.36□□□□□ -0.11
XKS1P42826 YIH1YCR059C 777 nt14.35□□□□□ -0.11
XKS1P42826 SDH1YKL148C 1923 nt14.34□□□□□ -0.11
XKS1P42826 PEX25YPL112C 1185 nt14.27□□□□□ -0.13
XKS1P42826 Q0182Q0182 405 nt14.22□□□□□ -0.13
XKS1P42826 YBR220CYBR220C 1683 nt14.21□□□□□ -0.13
XKS1P42826 NAT4YMR069W 858 nt14.21□□□□□ -0.13
XKS1P42826 YSP3YOR003W 1437 nt14.19□□□□□ -0.14
XKS1P42826 YLL053CYLL053C 459 nt14.19□□□□□ -0.14
XKS1P42826 BDH1YAL060W 1149 nt14.18□□□□□ -0.14
XKS1P42826 YSC84YHR016C 1407 nt14.16□□□□□ -0.14
XKS1P42826 YNL115CYNL115C 1935 nt14.16□□□□□ -0.14
XKS1P42826 FTR1YER145C 1215 nt14.13□□□□□ -0.15
XKS1P42826 AQY1YPR192W 918 nt14.13□□□□□ -0.15
XKS1P42826 YNL195CYNL195C 786 nt14.12□□□□□ -0.15
XKS1P42826 BIO4YNR057C 714 nt14.12□□□□□ -0.15
XKS1P42826 GLK1YCL040W 1503 nt14.11□□□□□ -0.15
XKS1P42826 GAL1YBR020W 1587 nt14.1□□□□□ -0.15
XKS1P42826 YLR415CYLR415C 339 nt14.08□□□□□ -0.16
XKS1P42826 RRT12YCR045C 1476 nt14.07□□□□□ -0.16
XKS1P42826 SSA4YER103W 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
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