Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 RTG1YOL067C 534 nt16.03■□□□□ 0.16
YJL225CP40889 IMP2'YIL154C 1041 nt15.99■□□□□ 0.15
YJL225CP40889 YJL152WYJL152W 360 nt15.96■□□□□ 0.15
YJL225CP40889 ERV46YAL042W 1248 nt15.95■□□□□ 0.14
YJL225CP40889 YDR095CYDR095C 411 nt15.95■□□□□ 0.14
YJL225CP40889 YCH1YGR203W 447 nt15.95■□□□□ 0.14
YJL225CP40889 YPS1YLR120C 1710 nt15.91■□□□□ 0.14
YJL225CP40889 TIR4YOR009W 1464 nt15.9■□□□□ 0.14
YJL225CP40889 MXR2YCL033C 507 nt15.85■□□□□ 0.13
YJL225CP40889 ALF1YNL148C 765 nt15.85■□□□□ 0.13
YJL225CP40889 SIS1YNL007C 1059 nt15.84■□□□□ 0.13
YJL225CP40889 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.82■□□□□ 0.12
YJL225CP40889 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.82■□□□□ 0.12
YJL225CP40889 MRPL8YJL063C 717 nt15.77■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.75■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 YEL076CYEL076C 651 nt15.75■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 YLR464WYLR464W 651 nt15.75■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 IDH1YNL037C 1083 nt15.73■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 UBX6YJL048C 1191 nt15.71■□□□□ 0.11
YJL225CP40889 GBP2YCL011C 1284 nt15.63■□□□□ 0.09
YJL225CP40889 YDR433WYDR433W 441 nt15.61■□□□□ 0.09
YJL225CP40889 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.61■□□□□ 0.09
YJL225CP40889 ADO1YJR105W 1023 nt15.6■□□□□ 0.09
YJL225CP40889 GFD2YCL036W 1701 nt15.57■□□□□ 0.08
YJL225CP40889 ART5YGR068C 1761 nt15.54■□□□□ 0.08
YJL225CP40889 PTP1YDL230W 1008 nt15.54■□□□□ 0.08
YJL225CP40889 YKR040CYKR040C 504 nt15.5■□□□□ 0.07
YJL225CP40889 PTH1YHR189W 573 nt15.47■□□□□ 0.07
YJL225CP40889 RPP2AYOL039W 321 nt15.44■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 RTS2YOR077W 699 nt15.44■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.44■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 YMR057CYMR057C 372 nt15.43■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 CAC2YML102W 1407 nt15.41■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 YDR094WYDR094W 336 nt15.4■□□□□ 0.06
YJL225CP40889 DCW1YKL046C 1350 nt15.39■□□□□ 0.05
YJL225CP40889 DED1YOR204W 1815 nt15.36■□□□□ 0.05
YJL225CP40889 FRD1YEL047C 1413 nt15.35■□□□□ 0.05
YJL225CP40889 TCD2YKL027W 1344 nt15.32■□□□□ 0.04
YJL225CP40889 MEP2YNL142W 1500 nt15.3■□□□□ 0.04
YJL225CP40889 SOR2YDL246C 1074 nt15.27■□□□□ 0.04
YJL225CP40889 RRD1YIL153W 1182 nt15.27■□□□□ 0.04
YJL225CP40889 SOR1YJR159W 1074 nt15.27■□□□□ 0.04
YJL225CP40889 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL225CP40889 PET9YBL030C 957 nt15.24■□□□□ 0.03
YJL225CP40889 SPT5YML010W 3192 nt15.21■□□□□ 0.03
YJL225CP40889 FPS1YLL043W 2010 nt15.2■□□□□ 0.02
YJL225CP40889 FMT1YBL013W 1206 nt15.19■□□□□ 0.02
YJL225CP40889 HUA1YGR268C 597 nt15.16■□□□□ 0.02
YJL225CP40889 IRC15YPL017C 1500 nt15.13■□□□□ 0.01
YJL225CP40889 PRE6YOL038W 765 nt15.06■□□□□ 0
YJL225CP40889 CUE1YMR264W 612 nt15.04■□□□□ -0
YJL225CP40889 EMI2YDR516C 1503 nt15.04■□□□□ -0
YJL225CP40889 PAU16YKL224C 372 nt15.02□□□□□ -0.01
YJL225CP40889 LCB1YMR296C 1677 nt15.02□□□□□ -0.01
YJL225CP40889 YCL042WYCL042W 360 nt15.02□□□□□ -0.01
YJL225CP40889 YLR235CYLR235C 399 nt14.98□□□□□ -0.01
YJL225CP40889 YKL030WYKL030W 606 nt14.9□□□□□ -0.02
YJL225CP40889 TIM23YNR017W 669 nt14.87□□□□□ -0.03
YJL225CP40889 SBA1YKL117W 651 nt14.86□□□□□ -0.03
YJL225CP40889 YDL221WYDL221W 552 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL225CP40889 CWP1YKL096W 720 nt14.84□□□□□ -0.03
YJL225CP40889 YFR018CYFR018C 1092 nt14.83□□□□□ -0.03
YJL225CP40889 ADH2YMR303C 1047 nt14.82□□□□□ -0.04
YJL225CP40889 FMP52YER004W 696 nt14.8□□□□□ -0.04
YJL225CP40889 DIC1YLR348C 897 nt14.78□□□□□ -0.04
YJL225CP40889 GIS3YLR094C 1509 nt14.77□□□□□ -0.05
YJL225CP40889 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.7□□□□□ -0.06
YJL225CP40889 YLR179CYLR179C 606 nt14.7□□□□□ -0.06
YJL225CP40889 SDH1YKL148C 1923 nt14.66□□□□□ -0.06
YJL225CP40889 YIL100WYIL100W 354 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL225CP40889 WSC2YNL283C 1512 nt14.62□□□□□ -0.07
YJL225CP40889 SCC4YER147C 1875 nt14.59□□□□□ -0.07
YJL225CP40889 SSA4YER103W 1929 nt14.57□□□□□ -0.08
YJL225CP40889 YIH1YCR059C 777 nt14.57□□□□□ -0.08
YJL225CP40889 SNF6YHL025W 999 nt14.54□□□□□ -0.08
YJL225CP40889 YPR064WYPR064W 420 nt14.52□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 YBR220CYBR220C 1683 nt14.51□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 PCM1YEL058W 1674 nt14.5□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 YFL066CYFL066C 1179 nt14.49□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 PEX25YPL112C 1185 nt14.47□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 YSC84YHR016C 1407 nt14.47□□□□□ -0.09
YJL225CP40889 YLL053CYLL053C 459 nt14.44□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 YMR090WYMR090W 684 nt14.44□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 RRT12YCR045C 1476 nt14.44□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 BIO4YNR057C 714 nt14.43□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 RRT5YFR032C 870 nt14.42□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 TAD3YLR316C 969 nt14.4□□□□□ -0.1
YJL225CP40889 FTR1YER145C 1215 nt14.37□□□□□ -0.11
YJL225CP40889 AHT1YHR093W 549 nt14.33□□□□□ -0.12
YJL225CP40889 RNQ1YCL028W 1218 nt14.32□□□□□ -0.12
YJL225CP40889 YSP3YOR003W 1437 nt14.31□□□□□ -0.12
YJL225CP40889 ATF2YGR177C 1608 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL225CP40889 YHL050CYHL050C 2094 nt14.27□□□□□ -0.12
YJL225CP40889 YNL115CYNL115C 1935 nt14.26□□□□□ -0.13
YJL225CP40889 BDH1YAL060W 1149 nt14.25□□□□□ -0.13
YJL225CP40889 TRM5YHR070W 1500 nt14.25□□□□□ -0.13
YJL225CP40889 GAL1YBR020W 1587 nt14.21□□□□□ -0.13
YJL225CP40889 MIR1YJR077C 936 nt14.21□□□□□ -0.13
YJL225CP40889 YNL195CYNL195C 786 nt14.2□□□□□ -0.14
YJL225CP40889 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.17□□□□□ -0.14
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