Protein–RNA interactions for Protein: P40454

RRD1, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRD1P40454 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.17□□□□□ -0.14
RRD1P40454 YKR040CYKR040C 504 nt14.16□□□□□ -0.14
RRD1P40454 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.12□□□□□ -0.15
RRD1P40454 RRT5YFR032C 870 nt14.11□□□□□ -0.15
RRD1P40454 RPM1RPM1 483 nt14.03□□□□□ -0.16
RRD1P40454 YFR018CYFR018C 1092 nt14.01□□□□□ -0.17
RRD1P40454 YDR433WYDR433W 441 nt13.99□□□□□ -0.17
RRD1P40454 SNF6YHL025W 999 nt13.97□□□□□ -0.17
RRD1P40454 YMR244WYMR244W 1068 nt13.95□□□□□ -0.18
RRD1P40454 IDH1YNL037C 1083 nt13.94□□□□□ -0.18
RRD1P40454 TRM9YML014W 840 nt13.92□□□□□ -0.18
RRD1P40454 TIM23YNR017W 669 nt13.89□□□□□ -0.19
RRD1P40454 PUN1YLR414C 792 nt13.88□□□□□ -0.19
RRD1P40454 YLR235CYLR235C 399 nt13.84□□□□□ -0.19
RRD1P40454 PRE6YOL038W 765 nt13.84□□□□□ -0.19
RRD1P40454 SAH1YER043C 1350 nt13.83□□□□□ -0.19
RRD1P40454 YKL030WYKL030W 606 nt13.73□□□□□ -0.21
RRD1P40454 MXR2YCL033C 507 nt13.71□□□□□ -0.21
RRD1P40454 NAT4YMR069W 858 nt13.69□□□□□ -0.22
RRD1P40454 RBG2YGR173W 1107 nt13.64□□□□□ -0.23
RRD1P40454 YJL152WYJL152W 360 nt13.63□□□□□ -0.23
RRD1P40454 GBP2YCL011C 1284 nt13.58□□□□□ -0.24
RRD1P40454 YBL100CYBL100C 315 nt13.56□□□□□ -0.24
RRD1P40454 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.54□□□□□ -0.24
RRD1P40454 GLR1YPL091W 1452 nt13.54□□□□□ -0.24
RRD1P40454 RAD51YER095W 1203 nt13.52□□□□□ -0.25
RRD1P40454 CCT6YDR188W 1641 nt13.5□□□□□ -0.25
RRD1P40454 INM2YDR287W 879 nt13.49□□□□□ -0.25
RRD1P40454 PTH1YHR189W 573 nt13.49□□□□□ -0.25
RRD1P40454 LCB1YMR296C 1677 nt13.47□□□□□ -0.25
RRD1P40454 FUN26YAL022C 1554 nt13.44□□□□□ -0.26
RRD1P40454 FRD1YEL047C 1413 nt13.43□□□□□ -0.26
RRD1P40454 NME1NME1 340 nt13.43□□□□□ -0.26
RRD1P40454 MSF1YPR047W 1410 nt13.41□□□□□ -0.26
RRD1P40454 SAM1YLR180W 1149 nt13.41□□□□□ -0.26
RRD1P40454 PTC2YER089C 1395 nt13.41□□□□□ -0.26
RRD1P40454 GLK1YCL040W 1503 nt13.38□□□□□ -0.27
RRD1P40454 DIC1YLR348C 897 nt13.34□□□□□ -0.27
RRD1P40454 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.28□□□□□ -0.28
RRD1P40454 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.28□□□□□ -0.28
RRD1P40454 YNR029CYNR029C 1290 nt13.28□□□□□ -0.28
RRD1P40454 TCD2YKL027W 1344 nt13.25□□□□□ -0.29
RRD1P40454 DAL1YIR027C 1383 nt13.2□□□□□ -0.3
RRD1P40454 ARE1YCR048W 1833 nt13.19□□□□□ -0.3
RRD1P40454 YFL066CYFL066C 1179 nt13.19□□□□□ -0.3
RRD1P40454 YPS1YLR120C 1710 nt13.19□□□□□ -0.3
RRD1P40454 THI74YDR438W 1113 nt13.17□□□□□ -0.3
RRD1P40454 BMT6YLR063W 1098 nt13.15□□□□□ -0.3
RRD1P40454 PEX25YPL112C 1185 nt13.14□□□□□ -0.31
RRD1P40454 NAB2YGL122C 1578 nt13.09□□□□□ -0.31
RRD1P40454 MIR1YJR077C 936 nt13.08□□□□□ -0.32
RRD1P40454 YMR226CYMR226C 804 nt13.07□□□□□ -0.32
RRD1P40454 PHO4YFR034C 939 nt13.05□□□□□ -0.32
RRD1P40454 FIS1YIL065C 468 nt13.05□□□□□ -0.32
RRD1P40454 YLR349WYLR349W 507 nt13.05□□□□□ -0.32
RRD1P40454 YCL042WYCL042W 360 nt13.03□□□□□ -0.32
RRD1P40454 PUT4YOR348C 1884 nt13.02□□□□□ -0.32
RRD1P40454 STE4YOR212W 1272 nt13.02□□□□□ -0.33
RRD1P40454 SOR2YDL246C 1074 nt13□□□□□ -0.33
RRD1P40454 SOR1YJR159W 1074 nt13□□□□□ -0.33
RRD1P40454 DED1YOR204W 1815 nt12.99□□□□□ -0.33
RRD1P40454 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
RRD1P40454 CAC2YML102W 1407 nt12.97□□□□□ -0.33
RRD1P40454 YPR064WYPR064W 420 nt12.96□□□□□ -0.33
RRD1P40454 ALF1YNL148C 765 nt12.95□□□□□ -0.34
RRD1P40454 YJR114WYJR114W 393 nt12.94□□□□□ -0.34
RRD1P40454 TAD3YLR316C 969 nt12.93□□□□□ -0.34
RRD1P40454 ADH7YCR105W 1086 nt12.92□□□□□ -0.34
RRD1P40454 NDI1YML120C 1542 nt12.91□□□□□ -0.34
RRD1P40454 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.9□□□□□ -0.34
RRD1P40454 PAU15YIR041W 375 nt12.89□□□□□ -0.35
RRD1P40454 DAT1YML113W 747 nt12.88□□□□□ -0.35
RRD1P40454 YGL034CYGL034C 366 nt12.87□□□□□ -0.35
RRD1P40454 YNL115CYNL115C 1935 nt12.83□□□□□ -0.36
RRD1P40454 CSM2YIL132C 642 nt12.82□□□□□ -0.36
RRD1P40454 RRD1YIL153W 1182 nt12.82□□□□□ -0.36
RRD1P40454 PUP1YOR157C 786 nt12.81□□□□□ -0.36
RRD1P40454 YSP3YOR003W 1437 nt12.79□□□□□ -0.36
RRD1P40454 YLR179CYLR179C 606 nt12.79□□□□□ -0.36
RRD1P40454 BUD23YCR047C 828 nt12.77□□□□□ -0.37
RRD1P40454 NAP1YKR048C 1254 nt12.76□□□□□ -0.37
RRD1P40454 FMT1YBL013W 1206 nt12.75□□□□□ -0.37
RRD1P40454 ESS1YJR017C 513 nt12.73□□□□□ -0.37
RRD1P40454 WSC2YNL283C 1512 nt12.72□□□□□ -0.37
RRD1P40454 AHT1YHR093W 549 nt12.7□□□□□ -0.38
RRD1P40454 BDH1YAL060W 1149 nt12.69□□□□□ -0.38
RRD1P40454 POA1YBR022W 534 nt12.68□□□□□ -0.38
RRD1P40454 RBG1YAL036C 1110 nt12.66□□□□□ -0.38
RRD1P40454 VPS75YNL246W 795 nt12.66□□□□□ -0.38
RRD1P40454 YMR057CYMR057C 372 nt12.63□□□□□ -0.39
RRD1P40454 GAL1YBR020W 1587 nt12.63□□□□□ -0.39
RRD1P40454 FUN14YAL008W 597 nt12.62□□□□□ -0.39
RRD1P40454 UBA4YHR111W 1323 nt12.58□□□□□ -0.4
RRD1P40454 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.56□□□□□ -0.4
RRD1P40454 PAU21YOR394W 495 nt12.56□□□□□ -0.4
RRD1P40454 PAU22YPL282C 495 nt12.56□□□□□ -0.4
RRD1P40454 SEN2YLR105C 1134 nt12.55□□□□□ -0.4
RRD1P40454 RNQ1YCL028W 1218 nt12.55□□□□□ -0.4
RRD1P40454 YLR279WYLR279W 390 nt12.54□□□□□ -0.4
RRD1P40454 YLR415CYLR415C 339 nt12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms