Protein–RNA interactions for Protein: P38737

ECM29, Proteasome component ECM29, yeastyeast

Predictions only

Length 1,868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM29P38737 ERV46YAL042W 1248 nt13.68□□□□□ -0.22
ECM29P38737 YCH1YGR203W 447 nt13.66□□□□□ -0.22
ECM29P38737 CCT6YDR188W 1641 nt13.65□□□□□ -0.22
ECM29P38737 FUN26YAL022C 1554 nt13.63□□□□□ -0.23
ECM29P38737 ADO1YJR105W 1023 nt13.59□□□□□ -0.23
ECM29P38737 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.57□□□□□ -0.24
ECM29P38737 YEL076CYEL076C 651 nt13.57□□□□□ -0.24
ECM29P38737 YLR464WYLR464W 651 nt13.57□□□□□ -0.24
ECM29P38737 SPP1YPL138C 1062 nt13.56□□□□□ -0.24
ECM29P38737 YJL152WYJL152W 360 nt13.52□□□□□ -0.25
ECM29P38737 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.5□□□□□ -0.25
ECM29P38737 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.5□□□□□ -0.25
ECM29P38737 UBX6YJL048C 1191 nt13.5□□□□□ -0.25
ECM29P38737 YDR095CYDR095C 411 nt13.45□□□□□ -0.26
ECM29P38737 SIS1YNL007C 1059 nt13.43□□□□□ -0.26
ECM29P38737 ALF1YNL148C 765 nt13.41□□□□□ -0.26
ECM29P38737 IDH1YNL037C 1083 nt13.4□□□□□ -0.26
ECM29P38737 YPS1YLR120C 1710 nt13.39□□□□□ -0.27
ECM29P38737 MXR2YCL033C 507 nt13.39□□□□□ -0.27
ECM29P38737 YDR094WYDR094W 336 nt13.36□□□□□ -0.27
ECM29P38737 TIR4YOR009W 1464 nt13.34□□□□□ -0.27
ECM29P38737 YKR040CYKR040C 504 nt13.29□□□□□ -0.28
ECM29P38737 GBP2YCL011C 1284 nt13.29□□□□□ -0.28
ECM29P38737 YDR433WYDR433W 441 nt13.21□□□□□ -0.29
ECM29P38737 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.16□□□□□ -0.3
ECM29P38737 CAC2YML102W 1407 nt13.11□□□□□ -0.31
ECM29P38737 PTH1YHR189W 573 nt13.1□□□□□ -0.31
ECM29P38737 GFD2YCL036W 1701 nt13.08□□□□□ -0.32
ECM29P38737 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.08□□□□□ -0.32
ECM29P38737 HUA1YGR268C 597 nt13.07□□□□□ -0.32
ECM29P38737 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.06□□□□□ -0.32
ECM29P38737 ART5YGR068C 1761 nt13.06□□□□□ -0.32
ECM29P38737 TCD2YKL027W 1344 nt13.04□□□□□ -0.32
ECM29P38737 PTP1YDL230W 1008 nt13.04□□□□□ -0.32
ECM29P38737 RPP2AYOL039W 321 nt13.02□□□□□ -0.32
ECM29P38737 FRD1YEL047C 1413 nt13.01□□□□□ -0.33
ECM29P38737 SOR2YDL246C 1074 nt13□□□□□ -0.33
ECM29P38737 SOR1YJR159W 1074 nt13□□□□□ -0.33
ECM29P38737 YMR057CYMR057C 372 nt12.99□□□□□ -0.33
ECM29P38737 DED1YOR204W 1815 nt12.97□□□□□ -0.33
ECM29P38737 SPT5YML010W 3192 nt12.93□□□□□ -0.34
ECM29P38737 PET9YBL030C 957 nt12.92□□□□□ -0.34
ECM29P38737 RRD1YIL153W 1182 nt12.89□□□□□ -0.35
ECM29P38737 MEP2YNL142W 1500 nt12.88□□□□□ -0.35
ECM29P38737 DCW1YKL046C 1350 nt12.88□□□□□ -0.35
ECM29P38737 PAU16YKL224C 372 nt12.87□□□□□ -0.35
ECM29P38737 YLR235CYLR235C 399 nt12.85□□□□□ -0.35
ECM29P38737 RTS2YOR077W 699 nt12.83□□□□□ -0.36
ECM29P38737 YFR018CYFR018C 1092 nt12.82□□□□□ -0.36
ECM29P38737 PRE6YOL038W 765 nt12.82□□□□□ -0.36
ECM29P38737 FMT1YBL013W 1206 nt12.82□□□□□ -0.36
ECM29P38737 YCL042WYCL042W 360 nt12.78□□□□□ -0.36
ECM29P38737 FPS1YLL043W 2010 nt12.77□□□□□ -0.36
ECM29P38737 LCB1YMR296C 1677 nt12.76□□□□□ -0.37
ECM29P38737 SBA1YKL117W 651 nt12.75□□□□□ -0.37
ECM29P38737 YKL030WYKL030W 606 nt12.74□□□□□ -0.37
ECM29P38737 CUE1YMR264W 612 nt12.69□□□□□ -0.38
ECM29P38737 TIM23YNR017W 669 nt12.69□□□□□ -0.38
ECM29P38737 EMI2YDR516C 1503 nt12.64□□□□□ -0.39
ECM29P38737 IRC15YPL017C 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
ECM29P38737 FMP52YER004W 696 nt12.63□□□□□ -0.39
ECM29P38737 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.61□□□□□ -0.39
ECM29P38737 YLR179CYLR179C 606 nt12.51□□□□□ -0.41
ECM29P38737 CWP1YKL096W 720 nt12.51□□□□□ -0.41
ECM29P38737 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
ECM29P38737 DIC1YLR348C 897 nt12.49□□□□□ -0.41
ECM29P38737 ADH2YMR303C 1047 nt12.47□□□□□ -0.41
ECM29P38737 YPR064WYPR064W 420 nt12.46□□□□□ -0.41
ECM29P38737 RRT5YFR032C 870 nt12.45□□□□□ -0.42
ECM29P38737 YDL221WYDL221W 552 nt12.44□□□□□ -0.42
ECM29P38737 YIH1YCR059C 777 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM29P38737 WSC2YNL283C 1512 nt12.37□□□□□ -0.43
ECM29P38737 SDH1YKL148C 1923 nt12.37□□□□□ -0.43
ECM29P38737 SNF6YHL025W 999 nt12.36□□□□□ -0.43
ECM29P38737 YFL066CYFL066C 1179 nt12.34□□□□□ -0.43
ECM29P38737 PEX25YPL112C 1185 nt12.34□□□□□ -0.43
ECM29P38737 YIL100WYIL100W 354 nt12.33□□□□□ -0.44
ECM29P38737 GIS3YLR094C 1509 nt12.32□□□□□ -0.44
ECM29P38737 TAD3YLR316C 969 nt12.29□□□□□ -0.44
ECM29P38737 YBR220CYBR220C 1683 nt12.25□□□□□ -0.45
ECM29P38737 SCC4YER147C 1875 nt12.24□□□□□ -0.45
ECM29P38737 YLL053CYLL053C 459 nt12.23□□□□□ -0.45
ECM29P38737 PCM1YEL058W 1674 nt12.22□□□□□ -0.45
ECM29P38737 FTR1YER145C 1215 nt12.22□□□□□ -0.45
ECM29P38737 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
ECM29P38737 YSC84YHR016C 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
ECM29P38737 YSP3YOR003W 1437 nt12.19□□□□□ -0.46
ECM29P38737 AHT1YHR093W 549 nt12.19□□□□□ -0.46
ECM29P38737 MIR1YJR077C 936 nt12.14□□□□□ -0.47
ECM29P38737 BIO4YNR057C 714 nt12.13□□□□□ -0.47
ECM29P38737 RNQ1YCL028W 1218 nt12.12□□□□□ -0.47
ECM29P38737 YNL115CYNL115C 1935 nt12.12□□□□□ -0.47
ECM29P38737 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
ECM29P38737 AQY1YPR192W 918 nt12.11□□□□□ -0.47
ECM29P38737 GLK1YCL040W 1503 nt12.1□□□□□ -0.47
ECM29P38737 BDH1YAL060W 1149 nt12.08□□□□□ -0.48
ECM29P38737 YLR415CYLR415C 339 nt12.08□□□□□ -0.48
ECM29P38737 MSF1YPR047W 1410 nt12.08□□□□□ -0.48
ECM29P38737 NAT4YMR069W 858 nt12.08□□□□□ -0.48
ECM29P38737 RRT12YCR045C 1476 nt12.07□□□□□ -0.48
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