Protein–RNA interactions for Protein: P37296

STV1, V-type proton ATPase subunit a, Golgi isoform, yeastyeast

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STV1P37296 UBX6YJL048C 1191 nt14.53□□□□□ -0.08
STV1P37296 LPX1YOR084W 1164 nt14.49□□□□□ -0.09
STV1P37296 SPP1YPL138C 1062 nt14.49□□□□□ -0.09
STV1P37296 CCT6YDR188W 1641 nt14.48□□□□□ -0.09
STV1P37296 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.46□□□□□ -0.09
STV1P37296 YEL076CYEL076C 651 nt14.46□□□□□ -0.09
STV1P37296 YLR464WYLR464W 651 nt14.46□□□□□ -0.09
STV1P37296 ADO1YJR105W 1023 nt14.44□□□□□ -0.1
STV1P37296 RTG1YOL067C 534 nt14.41□□□□□ -0.1
STV1P37296 ERV46YAL042W 1248 nt14.39□□□□□ -0.11
STV1P37296 YJL152WYJL152W 360 nt14.27□□□□□ -0.13
STV1P37296 SIS1YNL007C 1059 nt14.26□□□□□ -0.13
STV1P37296 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.23□□□□□ -0.13
STV1P37296 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.23□□□□□ -0.13
STV1P37296 IDH1YNL037C 1083 nt14.23□□□□□ -0.13
STV1P37296 YDR433WYDR433W 441 nt14.2□□□□□ -0.14
STV1P37296 ALF1YNL148C 765 nt14.18□□□□□ -0.14
STV1P37296 YKR040CYKR040C 504 nt14.16□□□□□ -0.14
STV1P37296 MXR2YCL033C 507 nt14.11□□□□□ -0.15
STV1P37296 TIR4YOR009W 1464 nt14.08□□□□□ -0.16
STV1P37296 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.08□□□□□ -0.16
STV1P37296 YDR095CYDR095C 411 nt14.07□□□□□ -0.16
STV1P37296 YDR094WYDR094W 336 nt14.06□□□□□ -0.16
STV1P37296 YPS1YLR120C 1710 nt14.05□□□□□ -0.16
STV1P37296 GBP2YCL011C 1284 nt14.04□□□□□ -0.16
STV1P37296 HUA1YGR268C 597 nt14.01□□□□□ -0.17
STV1P37296 CAC2YML102W 1407 nt13.83□□□□□ -0.2
STV1P37296 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.81□□□□□ -0.2
STV1P37296 FRD1YEL047C 1413 nt13.81□□□□□ -0.2
STV1P37296 YMR057CYMR057C 372 nt13.8□□□□□ -0.2
STV1P37296 ART5YGR068C 1761 nt13.8□□□□□ -0.2
STV1P37296 TCD2YKL027W 1344 nt13.77□□□□□ -0.21
STV1P37296 RPP2AYOL039W 321 nt13.77□□□□□ -0.21
STV1P37296 DED1YOR204W 1815 nt13.76□□□□□ -0.21
STV1P37296 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.76□□□□□ -0.21
STV1P37296 PTP1YDL230W 1008 nt13.74□□□□□ -0.21
STV1P37296 PTH1YHR189W 573 nt13.73□□□□□ -0.21
STV1P37296 SBA1YKL117W 651 nt13.71□□□□□ -0.21
STV1P37296 GFD2YCL036W 1701 nt13.7□□□□□ -0.22
STV1P37296 PET9YBL030C 957 nt13.7□□□□□ -0.22
STV1P37296 RRD1YIL153W 1182 nt13.67□□□□□ -0.22
STV1P37296 YKL030WYKL030W 606 nt13.64□□□□□ -0.23
STV1P37296 PAU16YKL224C 372 nt13.59□□□□□ -0.23
STV1P37296 LCB1YMR296C 1677 nt13.57□□□□□ -0.24
STV1P37296 YLR235CYLR235C 399 nt13.57□□□□□ -0.24
STV1P37296 FMT1YBL013W 1206 nt13.57□□□□□ -0.24
STV1P37296 FPS1YLL043W 2010 nt13.57□□□□□ -0.24
STV1P37296 SOR2YDL246C 1074 nt13.56□□□□□ -0.24
STV1P37296 SOR1YJR159W 1074 nt13.56□□□□□ -0.24
STV1P37296 YCL042WYCL042W 360 nt13.51□□□□□ -0.25
STV1P37296 MEP2YNL142W 1500 nt13.49□□□□□ -0.25
STV1P37296 PRE6YOL038W 765 nt13.47□□□□□ -0.25
STV1P37296 RTS2YOR077W 699 nt13.47□□□□□ -0.25
STV1P37296 YFR018CYFR018C 1092 nt13.45□□□□□ -0.26
STV1P37296 SPT5YML010W 3192 nt13.41□□□□□ -0.26
STV1P37296 DCW1YKL046C 1350 nt13.38□□□□□ -0.27
STV1P37296 RRT5YFR032C 870 nt13.35□□□□□ -0.27
STV1P37296 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.35□□□□□ -0.27
STV1P37296 IRC15YPL017C 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
STV1P37296 CWP1YKL096W 720 nt13.3□□□□□ -0.28
STV1P37296 TIM23YNR017W 669 nt13.29□□□□□ -0.28
STV1P37296 CUE1YMR264W 612 nt13.28□□□□□ -0.28
STV1P37296 ADH2YMR303C 1047 nt13.28□□□□□ -0.28
STV1P37296 FMP52YER004W 696 nt13.27□□□□□ -0.29
STV1P37296 DIC1YLR348C 897 nt13.24□□□□□ -0.29
STV1P37296 SNF6YHL025W 999 nt13.21□□□□□ -0.29
STV1P37296 YLR179CYLR179C 606 nt13.18□□□□□ -0.3
STV1P37296 EMI2YDR516C 1503 nt13.18□□□□□ -0.3
STV1P37296 GIS3YLR094C 1509 nt13.15□□□□□ -0.3
STV1P37296 YDL221WYDL221W 552 nt13.14□□□□□ -0.31
STV1P37296 WSC2YNL283C 1512 nt13.13□□□□□ -0.31
STV1P37296 YFL066CYFL066C 1179 nt13.12□□□□□ -0.31
STV1P37296 YPR064WYPR064W 420 nt13.12□□□□□ -0.31
STV1P37296 TAD3YLR316C 969 nt13.1□□□□□ -0.31
STV1P37296 PCM1YEL058W 1674 nt13.06□□□□□ -0.32
STV1P37296 AHT1YHR093W 549 nt13.06□□□□□ -0.32
STV1P37296 YIL100WYIL100W 354 nt13.05□□□□□ -0.32
STV1P37296 PEX25YPL112C 1185 nt13.05□□□□□ -0.32
STV1P37296 RNQ1YCL028W 1218 nt13.02□□□□□ -0.33
STV1P37296 NAT4YMR069W 858 nt13.01□□□□□ -0.33
STV1P37296 YIH1YCR059C 777 nt13□□□□□ -0.33
STV1P37296 SSA4YER103W 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
STV1P37296 YSP3YOR003W 1437 nt12.94□□□□□ -0.34
STV1P37296 BDH1YAL060W 1149 nt12.92□□□□□ -0.34
STV1P37296 YNL115CYNL115C 1935 nt12.92□□□□□ -0.34
STV1P37296 YMR090WYMR090W 684 nt12.89□□□□□ -0.35
STV1P37296 MSF1YPR047W 1410 nt12.88□□□□□ -0.35
STV1P37296 GLK1YCL040W 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
STV1P37296 SCC4YER147C 1875 nt12.87□□□□□ -0.35
STV1P37296 YMR244WYMR244W 1068 nt12.86□□□□□ -0.35
STV1P37296 SDH1YKL148C 1923 nt12.86□□□□□ -0.35
STV1P37296 MIR1YJR077C 936 nt12.85□□□□□ -0.35
STV1P37296 YSC84YHR016C 1407 nt12.83□□□□□ -0.36
STV1P37296 YLL053CYLL053C 459 nt12.83□□□□□ -0.36
STV1P37296 THI74YDR438W 1113 nt12.8□□□□□ -0.36
STV1P37296 FTR1YER145C 1215 nt12.78□□□□□ -0.36
STV1P37296 YLR415CYLR415C 339 nt12.77□□□□□ -0.37
STV1P37296 AQY1YPR192W 918 nt12.77□□□□□ -0.37
STV1P37296 GAL1YBR020W 1587 nt12.77□□□□□ -0.37
STV1P37296 BIO4YNR057C 714 nt12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms