Protein–RNA interactions for Protein: P34241

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB1P34241 LPX1YOR084W 1164 nt16.18■□□□□ 0.18
URB1P34241 ADO1YJR105W 1023 nt16.12■□□□□ 0.17
URB1P34241 TRM9YML014W 840 nt16.11■□□□□ 0.17
URB1P34241 FUN26YAL022C 1554 nt16.1■□□□□ 0.17
URB1P34241 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.1■□□□□ 0.17
URB1P34241 YEL076CYEL076C 651 nt16.1■□□□□ 0.17
URB1P34241 YLR464WYLR464W 651 nt16.1■□□□□ 0.17
URB1P34241 SPP1YPL138C 1062 nt16.09■□□□□ 0.17
URB1P34241 CCT6YDR188W 1641 nt16.02■□□□□ 0.16
URB1P34241 ERV46YAL042W 1248 nt16■□□□□ 0.15
URB1P34241 YJL152WYJL152W 360 nt15.87■□□□□ 0.13
URB1P34241 YDR095CYDR095C 411 nt15.85■□□□□ 0.13
URB1P34241 ALF1YNL148C 765 nt15.82■□□□□ 0.12
URB1P34241 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.81■□□□□ 0.12
URB1P34241 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.81■□□□□ 0.12
URB1P34241 YPS1YLR120C 1710 nt15.79■□□□□ 0.12
URB1P34241 YDR094WYDR094W 336 nt15.79■□□□□ 0.12
URB1P34241 SIS1YNL007C 1059 nt15.75■□□□□ 0.11
URB1P34241 TIR4YOR009W 1464 nt15.74■□□□□ 0.11
URB1P34241 IDH1YNL037C 1083 nt15.73■□□□□ 0.11
URB1P34241 MXR2YCL033C 507 nt15.72■□□□□ 0.11
URB1P34241 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.71■□□□□ 0.11
URB1P34241 YDR433WYDR433W 441 nt15.63■□□□□ 0.09
URB1P34241 YKR040CYKR040C 504 nt15.59■□□□□ 0.09
URB1P34241 GBP2YCL011C 1284 nt15.54■□□□□ 0.08
URB1P34241 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.53■□□□□ 0.08
URB1P34241 HUA1YGR268C 597 nt15.51■□□□□ 0.07
URB1P34241 GFD2YCL036W 1701 nt15.43■□□□□ 0.06
URB1P34241 ART5YGR068C 1761 nt15.4■□□□□ 0.06
URB1P34241 PTP1YDL230W 1008 nt15.39■□□□□ 0.05
URB1P34241 PTH1YHR189W 573 nt15.39■□□□□ 0.05
URB1P34241 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.39■□□□□ 0.05
URB1P34241 RPP2AYOL039W 321 nt15.37■□□□□ 0.05
URB1P34241 SBA1YKL117W 651 nt15.34■□□□□ 0.05
URB1P34241 CAC2YML102W 1407 nt15.33■□□□□ 0.05
URB1P34241 YMR057CYMR057C 372 nt15.31■□□□□ 0.04
URB1P34241 RTS2YOR077W 699 nt15.27■□□□□ 0.04
URB1P34241 PAU16YKL224C 372 nt15.26■□□□□ 0.03
URB1P34241 TCD2YKL027W 1344 nt15.25■□□□□ 0.03
URB1P34241 FRD1YEL047C 1413 nt15.23■□□□□ 0.03
URB1P34241 DCW1YKL046C 1350 nt15.21■□□□□ 0.02
URB1P34241 DED1YOR204W 1815 nt15.21■□□□□ 0.02
URB1P34241 MEP2YNL142W 1500 nt15.19■□□□□ 0.02
URB1P34241 PET9YBL030C 957 nt15.19■□□□□ 0.02
URB1P34241 SOR2YDL246C 1074 nt15.17■□□□□ 0.02
URB1P34241 SOR1YJR159W 1074 nt15.17■□□□□ 0.02
URB1P34241 RRD1YIL153W 1182 nt15.13■□□□□ 0.01
URB1P34241 PRE6YOL038W 765 nt15.11■□□□□ 0.01
URB1P34241 FPS1YLL043W 2010 nt15.06■□□□□ 0
URB1P34241 YLR235CYLR235C 399 nt15.06■□□□□ 0
URB1P34241 FMT1YBL013W 1206 nt15.03■□□□□ -0
URB1P34241 YFR018CYFR018C 1092 nt15.03■□□□□ -0
URB1P34241 YKL030WYKL030W 606 nt15.03■□□□□ -0
URB1P34241 LCB1YMR296C 1677 nt15.01□□□□□ -0.01
URB1P34241 SPT5YML010W 3192 nt15.01□□□□□ -0.01
URB1P34241 IRC15YPL017C 1500 nt14.97□□□□□ -0.01
URB1P34241 YCL042WYCL042W 360 nt14.97□□□□□ -0.01
URB1P34241 CUE1YMR264W 612 nt14.94□□□□□ -0.02
URB1P34241 EMI2YDR516C 1503 nt14.92□□□□□ -0.02
URB1P34241 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.83□□□□□ -0.04
URB1P34241 TIM23YNR017W 669 nt14.8□□□□□ -0.04
URB1P34241 RRT5YFR032C 870 nt14.77□□□□□ -0.05
URB1P34241 FMP52YER004W 696 nt14.76□□□□□ -0.05
URB1P34241 YDL221WYDL221W 552 nt14.75□□□□□ -0.05
URB1P34241 CWP1YKL096W 720 nt14.73□□□□□ -0.05
URB1P34241 SNF6YHL025W 999 nt14.73□□□□□ -0.05
URB1P34241 ADH2YMR303C 1047 nt14.69□□□□□ -0.06
URB1P34241 DIC1YLR348C 897 nt14.68□□□□□ -0.06
URB1P34241 GIS3YLR094C 1509 nt14.64□□□□□ -0.07
URB1P34241 YLR179CYLR179C 606 nt14.63□□□□□ -0.07
URB1P34241 YIL100WYIL100W 354 nt14.6□□□□□ -0.07
URB1P34241 SDH1YKL148C 1923 nt14.55□□□□□ -0.08
URB1P34241 YPR064WYPR064W 420 nt14.54□□□□□ -0.08
URB1P34241 SSA4YER103W 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
URB1P34241 YFL066CYFL066C 1179 nt14.52□□□□□ -0.08
URB1P34241 PEX25YPL112C 1185 nt14.52□□□□□ -0.08
URB1P34241 YIH1YCR059C 777 nt14.49□□□□□ -0.09
URB1P34241 WSC2YNL283C 1512 nt14.49□□□□□ -0.09
URB1P34241 SCC4YER147C 1875 nt14.48□□□□□ -0.09
URB1P34241 YMR090WYMR090W 684 nt14.44□□□□□ -0.1
URB1P34241 TAD3YLR316C 969 nt14.42□□□□□ -0.1
URB1P34241 NAT4YMR069W 858 nt14.4□□□□□ -0.1
URB1P34241 PCM1YEL058W 1674 nt14.4□□□□□ -0.1
URB1P34241 YBR220CYBR220C 1683 nt14.37□□□□□ -0.11
URB1P34241 GLK1YCL040W 1503 nt14.34□□□□□ -0.11
URB1P34241 YLL053CYLL053C 459 nt14.33□□□□□ -0.12
URB1P34241 YSC84YHR016C 1407 nt14.31□□□□□ -0.12
URB1P34241 MSF1YPR047W 1410 nt14.31□□□□□ -0.12
URB1P34241 BIO4YNR057C 714 nt14.31□□□□□ -0.12
URB1P34241 FTR1YER145C 1215 nt14.29□□□□□ -0.12
URB1P34241 MIR1YJR077C 936 nt14.29□□□□□ -0.12
URB1P34241 YSP3YOR003W 1437 nt14.28□□□□□ -0.12
URB1P34241 AHT1YHR093W 549 nt14.28□□□□□ -0.12
URB1P34241 RRT12YCR045C 1476 nt14.27□□□□□ -0.12
URB1P34241 YNL115CYNL115C 1935 nt14.27□□□□□ -0.12
URB1P34241 RNQ1YCL028W 1218 nt14.27□□□□□ -0.13
URB1P34241 YMR244WYMR244W 1068 nt14.26□□□□□ -0.13
URB1P34241 BDH1YAL060W 1149 nt14.19□□□□□ -0.14
URB1P34241 YNL195CYNL195C 786 nt14.18□□□□□ -0.14
URB1P34241 ATF2YGR177C 1608 nt14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms