Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoc3P33622 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoc3P33622 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoc3P33622 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoc3P33622 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoc3P33622 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoc3P33622 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoc3P33622 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoc3P33622 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apoc3P33622 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoc3P33622 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoc3P33622 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoc3P33622 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoc3P33622 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoc3P33622 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoc3P33622 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoc3P33622 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoc3P33622 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoc3P33622 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoc3P33622 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoc3P33622 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoc3P33622 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoc3P33622 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoc3P33622 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoc3P33622 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoc3P33622 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoc3P33622 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apoc3P33622 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoc3P33622 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc3P33622 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoc3P33622 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoc3P33622 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoc3P33622 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoc3P33622 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apoc3P33622 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoc3P33622 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc3P33622 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc3P33622 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms