Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Apoc3P33622 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Apoc3P33622 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Apoc3P33622 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Apoc3P33622 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Apoc3P33622 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Apoc3P33622 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Apoc3P33622 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Apoc3P33622 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Apoc3P33622 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Apoc3P33622 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Apoc3P33622 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Apoc3P33622 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Apoc3P33622 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Apoc3P33622 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Apoc3P33622 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Apoc3P33622 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Apoc3P33622 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Apoc3P33622 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Apoc3P33622 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Apoc3P33622 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Apoc3P33622 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Apoc3P33622 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apoc3P33622 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apoc3P33622 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apoc3P33622 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Apoc3P33622 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Apoc3P33622 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Apoc3P33622 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Apoc3P33622 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Apoc3P33622 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Apoc3P33622 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Apoc3P33622 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Apoc3P33622 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Apoc3P33622 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Apoc3P33622 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Apoc3P33622 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Apoc3P33622 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Apoc3P33622 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Apoc3P33622 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Apoc3P33622 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Apoc3P33622 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Apoc3P33622 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Apoc3P33622 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Apoc3P33622 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Apoc3P33622 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Apoc3P33622 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Apoc3P33622 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Apoc3P33622 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Apoc3P33622 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Apoc3P33622 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Apoc3P33622 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Apoc3P33622 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Apoc3P33622 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Apoc3P33622 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Apoc3P33622 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Apoc3P33622 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Apoc3P33622 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Apoc3P33622 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Apoc3P33622 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Apoc3P33622 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Apoc3P33622 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Apoc3P33622 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Apoc3P33622 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Apoc3P33622 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Apoc3P33622 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Apoc3P33622 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Apoc3P33622 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Apoc3P33622 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Apoc3P33622 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Apoc3P33622 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Apoc3P33622 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Apoc3P33622 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Apoc3P33622 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Apoc3P33622 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Apoc3P33622 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Apoc3P33622 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Apoc3P33622 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Apoc3P33622 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Apoc3P33622 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Apoc3P33622 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Apoc3P33622 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Apoc3P33622 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Apoc3P33622 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Apoc3P33622 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Apoc3P33622 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Apoc3P33622 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Apoc3P33622 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms