Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apoc3P33622 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apoc3P33622 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apoc3P33622 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apoc3P33622 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Apoc3P33622 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apoc3P33622 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apoc3P33622 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apoc3P33622 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apoc3P33622 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apoc3P33622 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apoc3P33622 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apoc3P33622 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apoc3P33622 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apoc3P33622 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apoc3P33622 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apoc3P33622 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apoc3P33622 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apoc3P33622 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apoc3P33622 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apoc3P33622 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apoc3P33622 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Apoc3P33622 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apoc3P33622 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apoc3P33622 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apoc3P33622 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apoc3P33622 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apoc3P33622 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apoc3P33622 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apoc3P33622 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apoc3P33622 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apoc3P33622 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apoc3P33622 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apoc3P33622 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apoc3P33622 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apoc3P33622 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apoc3P33622 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Apoc3P33622 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apoc3P33622 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apoc3P33622 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Apoc3P33622 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apoc3P33622 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apoc3P33622 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apoc3P33622 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoc3P33622 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoc3P33622 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apoc3P33622 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Apoc3P33622 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apoc3P33622 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apoc3P33622 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apoc3P33622 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apoc3P33622 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apoc3P33622 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apoc3P33622 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apoc3P33622 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoc3P33622 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apoc3P33622 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apoc3P33622 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apoc3P33622 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoc3P33622 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoc3P33622 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoc3P33622 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoc3P33622 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoc3P33622 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoc3P33622 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoc3P33622 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoc3P33622 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoc3P33622 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoc3P33622 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoc3P33622 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoc3P33622 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoc3P33622 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoc3P33622 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoc3P33622 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoc3P33622 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc3P33622 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc3P33622 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoc3P33622 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoc3P33622 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoc3P33622 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoc3P33622 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoc3P33622 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoc3P33622 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoc3P33622 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoc3P33622 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apoc3P33622 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoc3P33622 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoc3P33622 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms