Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms